超高速配列決定時代に対応した情報リソース開発

• 課題番号: 2010017056
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究期間: 2008-2012
• 年度: 2010
• 摘要: 高精度アノテーションを実行するパイプラインを作成し、一般ユーザーが大規模ゲノム決定に際して容易に利用できるウェブアプリケーションを構築した。イネゲノム配列を日米共同作業で再構築し、高速シーケンサーのデータを用いて、非常に微細な差を見る品種間比較などに利用可能な超高精度版を作成した。イネアノテーションのデータベースにおいて、機能記載、代謝情報、マーカー情報等を拡充した。本研究の基盤を活用し、遺伝子ファミリー、オオムギ完全長cDNA、アフリカ栽培イネ等の主要研究資源の配列解析を行い、データベースを作成した。
• カテゴリ: 大麦 データベース 品種