RNA-Seq法による品種間トランスクリプトーム比較解析手法の開発

• 課題番号: 2013024464
• 研究機関名: 独立行政法人農業生物資源研究所
• 研究期間: 2013-2017
• 年度: 2013
• 摘要: リファレンス3品種（日本晴、コシヒカリ、カサラス）と地域品種7種（コシヒカリSBL1、ほしのゆめ、ひとめぼれ、てんこもり、てんたかく、ヒノヒカリ、元気つくし）のNGSゲノム解読( 平均 x40のreadsで）を行い、データベース化し、PFT内で公開した。現在、論文作成中。おなじRNAで、マイクロアレイ解析とRNA-Seq解析を行い、互換性、優位性等を比較解析している。
• カテゴリ: データベース 品種