発現遺伝子群データベースの構築（１１１）

• 課題番号: 109
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 分子遺伝・（上席１）; 分子遺伝・ゲノ構造研
• 研究期間: 継１１～１３
• 年度: 2000
• 摘要: マイクロアレーを利用した遺伝子発現モニターシステムにおいてアレー化したｃＤＮＡクローンの塩基配列、類似性検索情報、イネゲノム中の位置情報などは得られた結果の解析に必須である。本課題においてはこの目的を満たすデータベース構築をおこなう。１１年度は農水省イネゲノム解析研究で得られた約４万個のｃＤＮＡクローン中から重複なしにアレー化するｃＤＮＡを選抜した。配列中のベクター配列や低品質配列を削除した後、ＢＬＡＳＴ２でグループ化を行い、８６１６個の独立シーケンスを確定した。今後のマイクロアレープロジェクトではこれらの独立グループから代表クローンが使用される。
• カテゴリ: データベース