Ｒｈｏｄｏｃｏｃｃｕｓ　ｅｑｕｉ病原因子の探索（１８）

• 課題番号: 23
• 研究機関名: 家畜衛生試験場
• 研究分担: 細菌寄生虫・病原機能研; （北里大学・獣医衛生）
• 研究期間: 完９～１１
• 年度: 2000
• 摘要: Rhodococcus equiが保有する８６ｋｂの病原プラスミドの全塩基配列決定をショットガンシークエンス法により行った。決定した配列は，これまでの予測よりも小さい80,610bpで，G+C%は64.6%であった。コンピューターによる解析で，66個の蛋白をコードする領域(ORF)の存在が推定され，それらは，全塩基配列の73.5%を占めていた。66個のORFのうち，データベースと有意な相同性を示したものは30個のみで，このうち11個は他の菌においても機能不明のものであった。既知の蛋白と相同性を示した19個の中には，15-17KDa抗原と高い相同性を示すORFが，さらに6個近傍に見いだされた。これらの遺伝子が存在する1～21,000bpの領域でのGC含量（59.0％）は，それ以外の領域や染色体DNAのGC含量（それぞれ67.5％と71.0％）よりも低く，またCodon usageにも著しい違いが見られ，さらにトランスポゾンの転移に関与する酵素に類似する遺伝子2個がこの領域を挟むように存在していることから，この領域がプラスミド上でのpathogenicity islandを形成しているものと推測された。
• カテゴリ: 害虫 データベース