探索・収集情報を元にした微生物遺伝資源の天然での所在情報の解析(72)

課題名 探索・収集情報を元にした微生物遺伝資源の天然での所在情報の解析(72)
課題番号 63
研究機関名 農業生物資源研究所
研究分担 遺資一・微生探索研
研究期間 完11~13(12)
年度 2000
摘要 過去の探索・収集・調査活動での野帳や研究資料等、糸状菌種の分離採取情報を一元的に統合し、菌種ごとの所在情報を蓄積・解析するため、11年度はMS Excelのスプレッド・シート上に共通フォーマットを考案したが、12年度には、異なった探索・収集情報の例を試作フォーマットに入力して問題点の検証を行いフォーマットの改良を行った。主表の菌種学名、菌株番号等、入力項目のうち、「地点の気象データ」を「近隣測点(近隣の気象観測地点名)」に置き換えた。「近隣測点」と関連する「測点の気象データ(年、月別、最高、最低、平均気温、等)」について別表1を作成し、理科年表上の1941-1970年平均の各データを入力した。また、分離菌株等、個々の菌種の「生育適温」、「(温度ごとの)成長率」等のデータも別表2として主表から分離した。日本各地やドイツにおけるコムギ等イネ科植物体上の微小菌類の現場調査結果等、過去の探索・収集による実際に利用できる個別の情報データを入力した。入力項目等の問題点を改善した後に、入力済みデータ・ファイルをMS Access等のデータベース形式に変換した。主表、別表1、別表2をリンクさせた。糸状菌群(種、属)ごと、分離地の年平均気温や宿主・分離源植物種・部位ごとに集約し、菌種の出現との間の相関を解析した。また、フザリウム属菌等、菌種単位の分布・出現マップを作成した。
カテゴリ 遺伝資源 データ管理 データベース

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