イネゲノムの構造解析（１０２）

• 課題番号: 94
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 分子遺伝・ゲノ構造研
• 研究期間: 完１０～１４（１２）
• 年度: 2000
• 摘要: 物理地図作製については、計5種類のライブラリー（RGP2種、CUGI２種、Monsantoクローン）15万クローンを利用して、EST マーカーによるスクリーニングを行ない、次にend sequenceを用いたwalking, STCを用いた virtual mapping を行った。これにより第1染色体のセントロメア、テロメア除く全域（47Mb）に物理地図を構築した。また第６染色体において約10Mbからなる物理地図を構築した。第１染色体のこれらのクローンは全てシーケンスされ、フェーズ２以上で公開された。13年2月までに配備された計20台のキャピラリーシーケンサーの能力を最大限に発揮するためにシステムの改良を行い、ショットガンライブラリー、コロニーピック、プラスミド抽出（自動化）、シーケンス反応および過剰試薬除去、キャピラリー電気泳動を全て96単位で行なうことが可能になった。現在第１、６染色体の計60Mbを公開している。