イネ穂ばらみ期耐冷性の異なる準同質遺伝子系統を用いたＡＦＬＰ解析（２０６）

• 課題番号: 181
• 研究機関名: 北海道農業試験場
• 研究分担: 地域基盤・冷害生理研; 地域基盤・（上席）; 作物開発・稲育種研
• 研究期間: 完９～１２
• 年度: 2000
• 摘要: 北海道のイネ品種「はやゆき」（耐冷性極強）に「豊光」（耐冷性弱）を反復戻し交配して育成した、穂ばらみ期耐冷性強の準同質遺伝子系統「５１０－２」（Ｂ５Ｆ５）と「豊光」を交配して得た９０のＦ２個体及びＦ３系統（各５個体）の穂ばらみ期耐冷性を冷水かけ流し水田で検定した。また、水田のＦ２個体から葉身を採取してＤＮＡを抽出し、これを鋳型としてＳＳＬＰ及びＡＦＬＰ解析を行った。ＳＳＬＰ解析には、ＭｃＣｏｕｃｈらのマイクロサテライトマーカー２９４種類を用い、ＡＦＬＰ解析には、ＥｃｏＲＩプライマー１０種類とＭｓｅＩプライマー１６種類（１６０組み合わせ）を用いた。ＡＦＬＰ解析では、ＥｃｏＲＩプライマー１０種類とＭｓｅＩプライマー１６種類との１６０組み合わせで約８，０００種類のＤＮＡ断片が増幅され、このうち耐冷性の強い「はやゆき」及び「５１０－２」でのみ増幅する断片が２０種類確認された。ＳＳＬＰ解析では、２９４のマイクロサテライトマーカーのうち、「５１０－２」と「豊光」との間で多型が認められた３つのマーカーを用いて、「５１０－２/豊光」のＦ２及びＦ３の解析を行ったところ、第８染色体上にあるＲＭ７２が、穂ばらみ期耐冷性と連鎖していることが判明した。従って、マイクロサテライトマーカーＲＭ７２を第８染色体上に座乗すると推定される「はやゆき」由来の穂ばらみ期耐冷性遺伝子の分子マーカーとして用いることができる。
• カテゴリ: 寒地 水田 品種