遺伝資源の情報管理・提供システムの高度化と遺伝資源情報の公開

• 課題番号: 2002002804
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ジーンバンク 上席研究官１; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ジーンバンク 上席研究官２; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ジーンバンク 動物資源研究チーム; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 遺伝資源研究グループ 上席研究官; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ジーンバンク 微生物資源研究チーム; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ 上席研究官; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ 植物ゲノム研究チーム; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ 家畜ゲノム研究チーム; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ 昆虫ゲノム研究チーム
• 協力分担関係: 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ 昆虫ゲノム研究チーム 門野敬子 ; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ 昆虫ゲノム研究チーム 山本公子 ; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ 昆虫ゲノム研究チーム 安河内祐二 ; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ ゲノム情報研究チーム 沼 寿隆 ; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ ゲノム情報研究チーム 馬場浩太郎 ; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ ＤＮＡバンク 長村吉晃 ; 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ ＤＮＡバンク 岩本政雄
• 研究期間: 継続2001～2002
• 年度: 2002
• 摘要: ホームページを更新するとともに、国際情勢に関するページを新たに開設して、関連情報を逐次提供した。在来家畜等動物遺伝資源についてNIAS遺伝資源国際ワークショップを開催し、国内外の連携構築を進めた。また、遺伝資源データベースの統合に向けて、学名、植物番号、微生物番号、動物番号を一体として扱える生物番号スキーマを開発して、データ移行を行うとともに、微生物在庫管理システムのプログラム開発を開始した。画像を含む特性調査項目について、データベースに登録するプログラムを開発し、動物の特性調査項目および植物の画像データ定義をデータベース化した。DNAバンクの利用システムの開発・提供においては、主にゲノム解析ツールであるイネゲノム自動アノテーションシステム(RiceGAAS)の改良とイネゲノムBLAST検索システム(RiceBLAST)の構築・整備を実施した。予測精度向上のため、新たに遺伝子予測プログラムFGENESHを導入した。イネゲノムBLAST検索システム(RiceBLAST)は、イネゲノム全塩基配列データ、ジャポニカ限定、インディカ限定等7種類の配列データセットに対して検索可能である。
• カテゴリ: 遺伝資源 管理システム データベース