メチル化部位のゲノムマッピング（Ａ２６２）

• 課題番号: 2004005131
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 分子遺伝研究グループ 遺伝子修飾研究チーム
• 研究期間: 継続2001～2005
• 年度: 2004
• 摘要: MspI/HpaIIを用いた制限酵素ランドマークゲノムスキャニング(RLGS)法により、 シロイヌナズナの3エコタイプ(Col, Ler, WS)の合計で4個(6％)のメチル化スポットが検出できた。また、ゲノムシークエンスデータベースを活用し、Colで18スポット(90％)の同定が可能であった。さらにメチル化多型サイトが、合計9サイト(17％)検出された。これにより3エコタイプのメチレーションコンパラティブマップを作成した結果、Colとの系統関係が近いLerにおいてメチル化サイトの類似傾向が示された。一方、イネについても日本晴のゲノムシーケンス情報を活用しながらゲノムメチレーション解析を進め、30サイト以上のメチル化サイトをマップした。
• カテゴリ: データベース