環境資源・環境負荷データの分類手法及び多変量解析手法の開発

• 課題番号: 2005007335
• 研究機関名: 農業環境技術研究所
• 研究分担: 農業環境技術研究所 地球環境部 環境統計ユニット
• 研究期間: 継続2001-2005
• 年度: 2005
• 摘要: 昨年度までに開発した系統樹高速計算アルゴリズムBOGENを中核として、1) 遺伝子などの配列データの入力、2) 最節約系統樹の推定、3) 最節約祖先配列の復元、4) 結果の出力までを一貫して分析する手順を確立するとともに、統合プログラムBALANCEを開発した。このシステムをアオコが産生する環境毒素（microcystin）に対する分解能をもつ細菌のリボソームDNAデータに適用することにより、これまで未発見だった分解菌が見つかるとともに、その毒素分解能を発現する遺伝子がある共通祖先に由来することが明らかになった。さらに、環境資源データの統計解析のためのプログラムを外部に公開した。