イネ染色体構造の解析

• 課題番号: 2005007193
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 ゲノム研究グループ 植物ゲノム研究チーム
• 協力分担関係: ＳＴＡＦＦ研究所; 岡山大学; INIBAP-IPGRI; CIRAD; EMBRA PA; U of Leicester; IEB
• 研究期間: 継続2004-2007
• 年度: 2005
• 摘要: 17年度は16年度終了した全塩基配列の根拠となるPAC/BAC/fosmid クローンを、物理地図を指標にして再構成し、minimal tiling pathとして整理し、IRGSPのホームページから公開するとともに保管した。IRGSPに対するクローンのリクエスト(NIAS DNABankを通じて)に対応している。テロメアについては昨年フォスミドクローンを位置づけた７カ所についてFiber FISHによるテロメアサイズの測定を行った。またフォスミドの配列解読によって染色体特異的なテロメアリピートの変異が発見された。またさらに７カ所のテロメア付近の構造が明らかになった。一方栽培イネの比較ゲノム解析のために、indica品種「Kasalath」のBACクローンを「日本晴」第１染色体配列を用いて迅速に整列化し、339個のBACからなる「Kasalath」第１染色体物理地図を構築した。FISHによるギャップ測定を考慮すると、「Kasalath」第１染色体の物理長は44.9Mbと推定される。
• カテゴリ: 品種