新規開発の制限酵素断片長多型(RFLP)マーカーを含むオオムギRFLP地図

タイトル 新規開発の制限酵素断片長多型(RFLP)マーカーを含むオオムギRFLP地図
担当機関 キリンビール醸造研究所
研究期間 1998~1998
研究担当者
発行年度 1998
要約 日本の二条ビールオオムギ「交A」と中国在来の六条オオムギ「木石港3」のF2個体を用い、86の新規オオムギRFLPマーカーを開発し、218座位からなる全長1400cMRFLP地図を作成した。
背景・ねらい わが国ではオオムギのRFLP地図は構築されてなく、オオムギの有用形質遺伝子をマップするには、海外のRFLPマーカー利用に依存している。しかし、海外のオオムギRFLPマーカーは200余りが公開され利用可能であるが不十分な数である。このため、わが国のオオムギRFLPマーカーを開発し、既存の海外RFLPマーカーを加えたRFLP地図を作成し、オオムギ有用形質遺伝子のマッピングに資する。
成果の内容・特徴
  1. 日本の二条ビールオオムギ「交A」と中国在来の六条オオムギ「木石港3」のF2120個体、RFLP検出に6種類の制限酵素(BamHI, Bgl Ⅱ, DraI, EcoRV, Hind Ⅲ, XbaI )を使用。
  2. 既存の海外RFLPマーカーは米国ワシントン大のDr.Kleinhofs(NABGM)、ドイツのDr.Graner(MWG)及びコーネル大学より分譲されたものを、さらに新たに交A由来のHpaⅡゲノミッククローン(JBGマーカー)とドイツ品種Igri カルス由来のcDNAクローン(JBCマーカー)を使用。
  3. 5μg/レーンのゲノミックDNAを用いてRFLPマーカーを非アイソトープ標識法(DIG法、ECL法)で標識してサザンハイブリダイゼーション分析し、RFLPマーカーのF2集団内の分離を調査。
  4. 遺伝子連鎖分析はMAPMAKER2.0を用い、連鎖の有意性を示す最小LOD値は3.0とする。
  5. 既存の88のRFLPマーカーと、新規な57のJBGマーカーと29のJBCマーカーがRFLPを示し、計218座位からなる全長1400cMのRFLP連鎖地図を作成(図1)。
成果の活用面・留意点
  1. 開発したRFLPマーカーはオオムギの有用形質遺伝子のマッピングに利用できる。
  2. 海外における既存の公開RFLPマーカーを入手する場合は開発者に分譲依頼する。
  3. 新規RFLPマーカーは九州農業試験場作物開発部育種工学研究室が公開する。
図表1 226240-1.gif
カテゴリ 育種 大麦 品種

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