（３）カイコ等昆虫のゲノムリソースの開発と利用

• 課題番号: 2009013981
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット; （独）農業生物資源研究所
• 協力分担関係: 国立大学法人東京大学; 社団法人農林水産先端技術産業振興センター
• 研究期間: 2006-2010
• 年度: 2009
• 摘要: １．カイコ完全長cDNAライブラリーについては、新たに３種のライブラリー（蛹期の翅、蛹期の精巣、蛹期の卵巣）を作成・解析した。これまでと合わせて20の異なる組織のライブラリーを解析し、中期計画の目標としていた12,000個以上の完全長cDNAクローンの配列決定を１年前倒しで達成した。２．塩基配列情報と遺伝地図・形質地図等とを統合した統合データベースKAIKObaseを整備し公開した。また、次年度に予定しているカイコゲノムアノテーションの環境を整えるため、コア・データベースを汎用性の高いChadoに移行して保守管理を容易にするとともに外部の他のデータベースとの連接性を高めた。さらに、ウンカ、ユスリカなどのcDNAデータベースにデータを追加するとともにヨコバイ、カメムシなどのデータベースを新たに構築した。３．カイコ遺伝子全28連鎖群中の164ヶ所のギャップのうち127ヶ所において、ギャップを埋めるブリッジBACを見いだしFISH法による確認を行った。４．カイコ変異系統の作出について、これまでのBmA3-GAL4 ミューテーターに加えて新たにAyFib-GAL4 ミューテーターを用いたエンハンサートラップ系統を作出し、発現解析や挿入位置解析を行った。また、エンハンサートラップ系統に加えてジーントラップ系統の作出と解析を始め、これまでに合計2,000 系統を作出する交配を完了し、中期計画目標を達成する目処をつけた。また、ここで確立した形質転換技術を、５．の遺伝子機能解析において候補遺伝子の機能の同定に利用した。５．遺伝子機能解析については、１型カイコ濃核病ウイルス抵抗性遺伝子nsd-1、Bt菌Cry1Ab毒素抵抗性遺伝子を単離し機能解析を進めている。また、着色非休眠卵（pnd、pnd-2）及び第２白卵（w-2）についても候補遺伝子をほぼ特定した。オープンラボ及びKAIKObaseを通じた情報提供により、外層黄繭（C ）、伴性赤蟻（sch）、褐円（L）、黄体色（lem）、ワクジー油（ow）、赤血（rb）、褐頭尾斑（bts）、エスプリ（spli）変異体の原因遺伝子同定に協力した。
• カテゴリ: カイコ カメムシ データベース 抵抗性遺伝子