ＳＳＣＰ法を用いた散在性反復配列の効率的な多型検出法の開発（３）

• 課題番号: 1997000833
• 研究機関名: 畜産試験場（畜試）
• 研究分担: 育種・家畜ゲノム
• 研究期間: 完Ｈ０６～Ｈ０８
• 年度: 1997
• 摘要: 高い感度で多型を検出できるＳＳＣＰ（一本鎖立体構造多型）解析について多型解析、連鎖解析への有用性についての検討、及び、ブタゲノム中の散在性反復配列（ＰＲＥ－１等）などの多型性マーカーとしての実用性の検討を行った。検索した６４２個のコスミドクローンの約７０％がＰＲＥ－１プローブに反応し、内２７個についてＰＲＥ－１配列の全長を決定できた。ＰＣＲ－ＳＳＣＰ解析により２７個のＰＲＥ－１配列の２４個で多型が検出でき、内８個のＰＲＥ－１配列を連鎖解析により連鎖地図上に位置づけた。コスミドをプローブとしたｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションにより決定された座乗染色体と連鎖解析の結果は一致した。また、マイクロサテライトの検出できないクローンにおいてもＰＲＥ－１が検出され、その有用性が明らかにされた。
• カテゴリ: 育種 豚