スギゲノム上の遺伝マーカーの開発と高密度基盤連鎖地図の確立（４４２）

• 課題番号: 405
• 研究機関名: 森林総合研究所
• 研究分担: 生物機能・遺伝分析研; 生物機能・集団遺伝研; 企画調整・実験林; 生物機能・（科長）; （派遣研究員）
• 研究期間: 継９～１３
• 年度: 2000
• 摘要: 3299クローンの塩基配列を解読した。またDNAデータベースとの相同性の検索では73％が既登録の配列と相同性があった。得られた塩基配列からPCRプライマーのデザインを行い、498個でこれらの遺伝子をPCR増幅することに成功している。現段階で280のSTSがCAPSマーカーとなった。クモトオシ×オキノヤマF2家系については新たに81個のCAPS及びRFLPマーカーのマッピングを行った。またクモトオシ×ハアラF1家系については305のAFLPマーカーと43のCAPSマーカーのマッピングを行った。これらを統合したところ10連鎖群について対応がついた。またこれらの情報のデーターベースを構築した。
• カテゴリ: 遺伝資源 データベース