豚椎骨数関与遺伝子の解明（２１）

• 課題番号: 19
• 研究機関名: 畜産試験場
• 研究分担: 育種・遺伝機能研; 育種・（上席１）; （STAFF）
• 研究期間: 継１０～１２
• 年度: 2000
• 摘要: ブタ第１染色体上の椎骨数関与遺伝子座の当該遺伝子の探索、解明を目的として、Sw705近傍のFTZ-F1遺伝子を候補遺伝子として解析した。BAC cloneを用いて主にゲノム構造の解析を行った。BAC cloneからshot gun clone及びdeletion cloneの作成を行い、およそ4000 cloneを単離し、insertを含むcloneのsequencingを行った。その結果、約2300本のsequence dataを得た。これらのsequencesのaligmentを行ったところ、概ね40本のcontigが得られ、合わせると約130kbpのBAC cloneのほとんどをカバーしていた。FTZ-F1のintronを含む遺伝子構造はおよそ30kbpで、FTZ-F1とSw705の距離もおよそ30kbp程度である事がわかった。また、exon及びintronの塩基配列約8kbpを決定した過程でintronに多型を検出した。
• カテゴリ: 育種 豚