スギゲノム上の遺伝マーカーの開発と高密度基盤連鎖地図の確立（４０５）

• 課題番号: 319
• 研究機関名: 森林総合研究所
• 研究分担: 生物機能・遺伝分析研; 生物機能・集団遺伝研; 企画調整・実験林; 生物機能・（科長）; （派遣研究員）; （特別研究員）
• 研究期間: 止９～１２～（１３）
• 年度: 2000
• 摘要: 部分塩基配列の解読を行い、合計6746クローンのデータを得ている。またDNAデータベースとの相同性の検索では73％ほどが既登録の配列と相同性があった。簡便なPCRマーカーを作出するためにPCRプライマーのデザインを行った。1220のPCRプライマーのうち、現段階で347のSTSがCAPSマーカーとなった。高密度化な連鎖地図の作製のために81YA-1-96×81YA-1-38F2家系でのマッピングをRFLP法及びCAPS法を用いて行った。遺伝資源の評価のために23集団でから材料を収集した。これらの部分塩基配列情報及びPCRプライマー情報のデータベースを構築した。(森林総研）
• カテゴリ: 遺伝資源 データベース