ブタの高密度遺伝地図、物理地図の作成

• 課題番号: 2002002690
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 基盤研究部門 ゲノム研究グループ 家畜ゲノム研究チーム
• 研究期間: 継続2001～2002
• 年度: 2002
• 摘要: 免疫系の制御に関わるブタゲノム上の領域（T細胞レセプターデルタ鎖可変領域・1番染色体上のType-Iインターフェロン・13番染色体上のケモカインレセプター）のBACコンティグを作製し、その塩基配列の内、現在までに600kb以上について明らかにした。800以上のマイクロサテライトマーカーを中心としたブタDNAマーカーのデータベースを整備し、マーカー情報及び連鎖地図の閲覧システムを作製・公開した。また塩基配列解析のためのデータベースシステムを構築し、ブタESTのクラスタリングシステムの検討・開発、クラスタリング結果のデータベース化を行い、ESTクラスターのヒト・マウス等の遺伝子あるいはヒトゲノムシーケンスに対する相同性の解析結果及び遺伝子機能の分類結果の検索を可能とするデータベースシステムの開発を行った。
• カテゴリ: カイコ データベース DNAマーカー 豚