遺伝子発現モニタリングシステムの構築

• 課題番号: 2005007205
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 分子遺伝研究グループ 遺伝子発現研究チーム
• 協力分担関係: 韓国農村振興庁; CAAS; CIAT; IRRI; CIRAD
• 研究期間: 継続2001-2006
• 年度: 2005
• 摘要: マイクロアレイデータの性質に適合したクラスター分析とデータマイニングの方法論について検討した。現時点で有望と考えている手法の一つはアソシエーションルール分析と呼ばれる手法で、様々な方法で定義した遺伝子群の間の相関性を定量的に評価できる。現在、この手法でTranscription Unitごとの上流配列1,000bpにおける塩基配列エレメントの分布と発現データとの関連性を見出せないか検討中である。約90種類の組織特異的イネプロモーターをgusにつないでイネに導入・解析し、種々の組織特異的あるいは構成的発現パターンを付与する約20種類のプロモーターを得た。誘導的発現が期待される約30種類のイネプロモーターについても同様の解析を行い、植物ホルモンや窒素源依存的に発現が誘導／抑制されるプロモーターを得た。通算7,000個体以上のFOXイネ系統を作出し、うち約3,200系統で導入cDNAを同定した。ZIMモチーフを有する転写制御因子の過剰発現により生育・花成促進や多収性をもたらす系統を得た。培養温度の検討、界面活性剤の使用により、イネ形質転換系を改良できることがわかった。
• カテゴリ: 多収性 モニタリング