国内に発生する脱粒性の日本型雑草イネは脱粒性遺伝子qSH1が機能型である

• 担当機関: （独）農業・食品産業技術総合研究機構 中央農業総合研究センター
• 研究期間: 2006～2008
• 研究担当者: 牛木 純; 赤坂舞子; 渡邊寛明
• 発行年度: 2008
• 要約: 国内に発生する日本型雑草イネの多くは、自然脱粒性を持ち、脱粒性遺伝子qSH1が機能型の塩基配列である。一方、脱粒性遺伝子sh4は非機能型の塩基配列である。
• キーワード: 雑草イネ、自然脱粒性、脱粒性遺伝子、qSH1、sh4
• 背景・ねらい: 雑草イネは、世界各地の水稲栽培地域、特に直播栽培地域で発生が問題となっている。日本では、多様な形態を持つ玄米が赤色の雑草イネと、形態が栽培品種に似た玄米が白色の雑草イネが発生している。国内に発生する雑草イネの多くは、日本型で自然脱粒性を持つ点で共通している。一方、イネの脱粒性に関わる遺伝子はQTL (Quantitative trait locus) 解析により、第10染色体を除く全ての染色体上にあると推定されており、これまでに、第1染色体からは離層形成に関わる遺伝子qSH1（Konishi et al. 2006）、第4染色体からは自然脱粒性に関わる遺伝子sh4（Li et al. 2006）が単離されている。それらの遺伝子が機能するか否かは、特定の塩基配列の多型性（Functional nucleotide polymorphism、FNP）により判定できる。国内に発生する雑草イネの脱粒性メカニズムを解明するために、上記脱粒性遺伝子のFNPを明らかにする。

成果の内容・特徴

1. 玄米が赤色の雑草イネの多くは、qSH1のFNPが機能型で脱粒性が高い。一部の雑草イネは、qSH1のFNPが非機能型であり、脱粒性は比較的低い（表１）。
2. 玄米が白色の雑草イネのqSH1のFNPは機能型で脱粒性が高い（表１）。
3. 上記の雑草イネの脱粒性遺伝子sh4のFNPは全て非機能型である（表１）。
4. 玄米が白色の雑草イネと形態が類似する一部の栽培品種は、qSH1のFNPが機能型であるが、雑草イネに比べて脱粒性は低い（表１）。

成果の活用面・留意点

1. 雑草イネに特有の自然脱粒性メカニズムの解明に活用する。
2. 雑草イネを判別する際の指標の一つとして活用する。
3. 雑草イネの日本型・インド型は、佐藤(1991)の方法により判別した。

• カテゴリ: 病害虫 雑草イネ 直播栽培 水稲 品種