水稲第６染色体長腕末端領域に座乗する新規の低アミロース性QTL

• 担当機関: （独）農業・食品産業技術総合研究機構 北海道農業研究センター
• 研究期間: 2006～2008
• 研究担当者: 松葉修一; 船附稚子; 黒木慎; 横上晴郁; 清水博之
• 発行年度: 2008
• 要約: 由来の異なる４つの低アミロース品種・系統、「はなえまき」「柔小町」「zt14」「EM15」では、第６染色体長腕末端の共通した領域にそれぞれの低アミロース性QTLが座乗し、SSRマーカーを用いた選抜が可能である。
• キーワード: 水稲、低アミロース、DNAマーカー、はなえまき、柔小町

背景・ねらい

米のアミロース含有率は、食味を左右する大きな要因であり、特に粘りを決定づける。アミロース含有率が適度に低い品種・系統は適度に粘り、食味が優れるものとして、わが国の良食味米育種に用いられている。また、低アミロース性を効率よく導入するためには、DNAマーカーを利用した育種選抜が有効である。そこで、いくつかの低アミロース品種がもつ低アミロース性QTLを解析し、選抜DNAマーカーの開発を行う。

成果の内容・特徴

1. 由来の異なる４つの低アミロース品種・系統、「はなえまき」「柔小町」「zt14」「EM15」では、それぞれと「初雫」との交配後代のF2集団の解析の結果、第６染色体長腕末端領域に共通して座乗するQTL（qLAC6h、 qLAC6y、 qLAC6z、 qLAC6e）が低アミロース性に大きく関与しており、近傍のRM7555等のSSRマーカーで検出できる（図１、表１）。
2. 上記の４品種・系統を用いた交配後代のF2解析集団では、qLAC6h、 qLAC6y、 qLAC6z、 qLAC6eをホモで持つことによって、持たない場合と比べて、アミロース含有率は有意に低減する（表１、図２）。
3. 2007年度に北海道農研（札幌市）の温室で養成した、上記の４品種・系統と「初雫」との交配後代のF2解析集団では、４つの低アミロース性QTL（qLAC6h、 qLAC6y、 qLAC6z、 qLAC6e）をホモで持つことによって、アミロース含有率（%）はそれぞれ平均して8.4、10.7、9.8、8.7の低減効果がある（表１、図２-A）。また、2008年度の北海道農研の水田圃場で養成した「北海300号／はなえまき」のF2集団においても、qLAC6hをホモで持つことによって、アミロース含有率（%）は平均して9.5の低減効果がある（図２-B）。

成果の活用面・留意点

1. 本研究で見いだされたQTLは、上記４つの品種・系統を供与親とした低アミロース性のマーカー育種に利用可能である。
2. 選抜に利用可能なSSRマーカーは、International Rice Genome Sequencing Project（2005、Nature 436:793-800）によって開発・公開されている。
3. ４つの低アミロース性QTLの機能等については、未解明である。

• カテゴリ: 育種 水田 水稲 DNAマーカー 品種 良食味