外被蛋白質の遺伝子解析に基づくソラマメウイルトウイルスの分類

タイトル 外被蛋白質の遺伝子解析に基づくソラマメウイルトウイルスの分類
担当機関 農業研究センター
研究期間
研究担当者
発行年度 1998
要約 日本および海外で分離されたソラマメウイルトウイルス(BBWV)分離株の外被蛋白質遺伝子を解析し、予測されるアミノ酸配列の相同性を比較したところ、日本の4分離株はBBWV2に属した。
背景・ねらい ソラマメウイルトウイルス(BBWV)は宿主範囲が広く、日本各地で多数分離されている。これまで海外産BBWVの多くは、血清学的手法(寒天ゲル内二重拡散法)により2つの種(BBWV1およびBBWV2)に分類されてきたが、同手法による反応は不安定で、分離株の種の識別は困難であった。そこで、日本および海外の数種BBWV分離株の外被蛋白質遺伝子を解析し、日本産分離株の分類学的な位置付けを明らかにする。
成果の内容・特徴
  1. 6種のBBWV分離株(1-2、L、E、IP、PV132およびPV176)の外被蛋白質遺伝子の塩基配列を決定し、予測されるアミノ酸配列の相同性を比較した(表1)。
  2. 日本の4分離株は、BBWV2(PV131)と90.8~96.3%の高い相同性を示したが、BBWV1(PV132およびPV176)とは61.9~63.8%の相同性にとどまった。
  3. 以上の結果に基づき系統樹(NJ法およびUPGMA法)を作成したところ、BBWV1およびBBWV2は分子レベルでも異なる種として位置付けられることを確認し、日本の4分離株はBBWV2に属することを明らかにした(図1)。
成果の活用面・留意点
  1. 得られた塩基配列情報は、遺伝子診断法によるBBWV1とBBWV2の識別に利用できる。
  2. BBWV1が日本国内に存在するかどうかについて、今後の検討が必要である。
図表1 224244-1.gif
図表2 224244-2.gif
カテゴリ 病害虫 そらまめ

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