ＳＳＲマーカーによるシバの品種識別技術

タイトル	ＳＳＲマーカーによるシバの品種識別技術
担当機関	（独）農業・生物系特定産業技術研究機構畜産草地研究所
研究期間	2003～2005
研究担当者	蝦名真澄高原学中川仁霍田真一
発行年度	2003
要約	シバ品種「朝駆」のゲノムライブラリーから開発したSSRマーカーは、シバ品種・系統を効率よく識別できる。また、他の種でもバンドの増幅が見られ、シバ属に広く利用できる。
キーワード	飼料作物育種、イネ科牧草、シバ、SSR、品種識別
背景・ねらい	種苗法に基づく育成者権保護制度の制定にともない、品種の区別性や均一性を検証するための迅速・簡易な品種識別技術の早期確立が強く求められている。特に、類似品種の判別に有効な指標形質が少なく、かつ、栄養繁殖によって容易に増殖することが可能なシバでは、信頼性の高い客観的な識別技術の開発は急務となっている。本課題は、ゲノム中に散在する単純反復配列（SSR）を利用した再現性の高いDNAマーカーを開発し、それを利用したシバの品種識別技術の確立を目的とする。
成果の内容・特徴	１．シバ品種「朝駆」由来のAG/TC濃縮ゲノムライブラリーから160クローンを選抜し、そのうち119クローンでSSR領域が認められた。119のSSR領域における反復回数は、8-28回の範囲であった（図1）。２．上記119種類のうち32種類のSSR領域についてプライマーを設計し、これをもとに23種類のSSRマーカーを開発できた。３．「朝駆」を含むシバ5品種・系統を用いてSSR解析を行った。供試した全ての品種・系統で異なるバンドパターンが得られ、効率よく各品種・系統の遺伝子型を判定することができる（図2）４．開発したSSRマーカーは、シバのみならず、コウライシバ、コウシュンシバおよびオニシバでも増幅することが認められ、シバ属に広く適用できる（表1）。
成果の活用面・留意点	１．客観的で信頼性の高いシバ品種の識別が可能となる。２．新たな育成品種にも迅速に対応するため、SSRマーカーによって既存品種・系統の遺伝子型を整理する必要がある。３．１クローン由来の栄養繁殖性品種以外では、別途検討が必要である。
図表1
図表2
図表3
カテゴリ	育種飼料作物 DNAマーカー繁殖性改善品種