ＲＡＰＤマーカーによるスイカ連鎖地図の作成

• 担当機関: 野菜・茶業試験場
• 研究期間: 1994～1995
• 発行年度: 1994
• 要約: ＤＮＡ多型（ＲＡＰＤ）を用いてスイカ連鎖地図を作成した。果皮模様および果肉色に関する遺伝子の連鎖地図上の位置が定められた。
• 背景・ねらい: ＤＮＡ多型に基づいて作成される連鎖地図の利用は育種の効率的推進上で大きく貢献すると考えられる。そこで任意な配列のプライマーによって増幅されるＤＮＡ多型(RAPD：random amplified polymorphic DNA）を用いてスイカの連鎖地図を作成する。

成果の内容・特徴

1. 　スイカ栽培品種Ｈ－７（縞皮・赤肉・大球、固定品種）と固定系統Ｓ－１（無地皮・白肉・超大球）、そのＦ１をＳ－１に戻し交雑したＢＣ2７０個体、Ｈ－７に戻し交雑したＢＣ1６０個体を材料とした。それぞれの個体からＣＴＡＢ法でＤＮＡを抽出し、これを鋳型としてＰＣＲを行った。増幅されたバンド間および形態的形質との連鎖については　Mapmakerによって解析した。
   
2. 　Ｈ－７とＳ－１を識別できるバンドのうち、Ｈ－７に特異的な９２本のバンドが得られた。このうち５０がマーカーとして利用できるものであった。Ｓ－１に戻し交雑した　ＢＣ１世代における分離を解析した結果、４０個のマーカーが１０の連鎖群に分類され、連鎖地図上の位置が決定された。また濃緑縞模様果皮に関する遺伝子が連鎖群Ⅰに属した（図１）。
   
3. 　Ｓ－１に特異的なバンドは１１８本であり、このうち連鎖解析に使用できるマーカーは８５個であった。Ｈ－７に戻し交雑したＢＣ１世代におけるこれらマーカーの分離を解析した結果、７６個のマーカーが１１連鎖群に分類され、全長６１４ｃＭの地図の位置が決定された。縞模様果皮に関する遺伝子が連鎖群IIIに、赤色果肉に関する遺伝子が連鎖群IIにそれぞれ属した（図省略）。
   

成果の活用面・留意点

1. 　スイカは染色体数から１１の連鎖群が期待される。今回の連鎖群の中には全長の短いものがあり、さらに多くのマーカーを用いて連鎖地図を精密にする必要がある。
   
2. 　果皮模様、果肉色以外の農業形質についても地図上の位置を決定する必要がある。
   
3. 　より実用品種に近い交配組み合わせでの地図が必要である。
   

• カテゴリ: 育種 すいか 品種