タイトル | メロンF1種子純度検定および品種識別に利用可能なSSRマーカー |
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担当機関 | (独)農業・生物系特定産業技術研究機構 野菜茶業研究所 |
研究期間 | 2002~2004 |
研究担当者 |
小倉健生(協和種苗) 松元 哲 吹野伸子 國久美由紀 |
発行年度 | 2004 |
要約 | 開発したメロン単純反復配列(SSR、マイクロサテライト)マーカーは多型性に富み、F1種子純度検定や品種識別に利用できる。 |
キーワード | メロン、単純反復配列、SSR、マイクロサテライト、多型、F1種子純度検定、品種識別 |
背景・ねらい | メロンは種子および生産物の価格が高いため、F1種子純度検定および品種識別に利用可能なDNAマーカーの開発が望まれている。しかし用いる品種・系統の組み合わせによっては遺伝変異が小さく、DNA多型の検出が困難である。そこで多型性に優れるSSRマーカーを開発し、F1種子純度検定および品種識別への利用を図る。 |
成果の内容・特徴 | 1. メロン品種「春系3号」のゲノムDNAをもとに4種類の反復配列に関して作成したライブラリーからSTS化したSSRの数は約200個である。 2. 開発したSSRマーカーは多型性に富み、変種・品種間多型を容易に検出できる(図1)。 3. 市販F1品種の交配親として用いられている系統についてもこれらSSRマーカーを用いることにより識別可能である(表1)。 4. 開発したSSRマーカーの一部(21-25など)は、「愛知3号」(愛知農総試育成)と「久留米MP-4」(野菜茶研育成)との交雑F1である「アールス輝」(野菜茶研・愛知農総試共同育成)の純度検定に利用できる(図2)。 |
成果の活用面・留意点 | 1. 開発したマーカーの中にはキュウリのDNA多型を検出できるものがあり、それらはキュウリF1品種の純度検定に利用できる可能性がある。 2. 多型バンドのサイズ差が大きい場合にはアガロースゲルでの検出が可能である。差が小さい場合にはシーケンサーもしくはアクリルアミドゲルで検出する。 |
図表1 | |
図表2 | |
図表3 | |
カテゴリ | きゅうり 茶 DNAマーカー 品種 メロン |