タイトル | 染色体に対応付けられた単純反復配列(SSR)を基にしたネギ連鎖地図 |
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担当機関 | (独)農業・食品産業技術総合研究機構 野菜茶業研究所 |
研究期間 | 2004~2008 |
研究担当者 |
河野いづみ(STAFF 研) 金森裕之(STAFF 研) 山下謙一郎 執行正義(山口大農) 若生忠幸 小原隆由 小島昭夫 塚崎光 布目司 福岡浩之 米丸淳一(生物研) |
発行年度 | 2008 |
要約 | 約250個のネギ単純反復配列(SSR)マーカーおよびタマネギ発現遺伝子配列タグ(EST)マーカーで構築された連鎖地図は、17連鎖群、全長2116cMである。これらの連鎖群は、ネギおよびタマネギの染色体と対応付けられている。 |
キーワード | ネギ、連鎖地図、DNAマーカー、マイクロサテライト、染色体、タマネギ |
背景・ねらい | 有用形質の遺伝様式を明らかにするためには、連鎖地図を用いたQTL解析が有効である。また、汎用性の高いDNAマーカーを利用した連鎖地図を構築することにより、近縁種とのシンテニー(異なる種の染色体間で遺伝子の配列が類似していること)を利用した有用形質のマッピングも可能となる。しかし、ネギ属野菜ではゲノム情報の蓄積が乏しく、DNAマーカーの開発が遅れており、遺伝子型の識別能が高い共優性マーカーを主体とした連鎖地図は構築されていない。そこで、ネギおよびタマネギの遺伝情報から、共優性を示し、汎用性の高いDNAマーカーを基にしたネギ連鎖地図を構築する。 |
成果の内容・特徴 |
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成果の活用面・留意点 |
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図表1 | ![]() |
図表2 | ![]() |
カテゴリ | たまねぎ DNAマーカー ねぎ 品種 |