タイトル | 牛由来Salmonella Typhimuriumの遺伝子型に基づくデータベースの構築 |
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担当機関 | (独)農業・食品産業技術総合研究機構 動物衛生研究所 |
研究期間 | 2008~2012 |
研究担当者 |
玉村雪乃 内田郁夫 田中 聖 秋庭正人 秦 英司 菅野 徹 黒澤 篤 今村 毅 小林亜由美 湯川尚一郎 田村 豊 |
発行年度 | 2012 |
要約 | Multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA)およびパルスフィールドゲル電気泳動 (PFGE)プロファイルに基づくデータベースを用いることにより、流行型のモニタリングや新型菌の検出が可能となる。MLVAによる識別能力はPFGEと比較して高いが、両者を併用することで、菌株間の関連性をより詳細に解析することが可能となる。 |
キーワード | Salmonella Typhimurium、Salmonella O4:i:-、PFGE、MLVA |
背景・ねらい | Salmonella Typhimurium (ST) は、子牛だけでなく搾乳牛にもサルモネラ症を引き起こし、酪農経営上大きな問題となる。流行株の特徴や感染源・感染経路等を迅速に把握することが、防疫対策を講じる上で重要であり、そのための技術・手法の確立が必要となる。本研究では、菌株間の関連性を解析する手法として、ゲノムDNAを制限酵素で切断し、そのプロファイルを比較するパルスフィールドゲル電気泳動 (PFGE)と併せて、データベース化が容易な方法として、ゲノム中の縦列反復配列数を解析するmultiple-locus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA) 法を用い、牛由来STおよびSalmonella O4:i:- の型別を実施する。 |
成果の内容・特徴 |
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成果の活用面・留意点 |
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図表1 | ![]() |
研究内容 | http://www.naro.affrc.go.jp/project/results/laboratory/niah/2012/170e1_02_26.html |
カテゴリ | 経営管理 データベース 乳牛 モニタリング 薬剤耐性 |