ブタの高密度遺伝地図、物理地図の作成

• 課題番号: 2003003949
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 ゲノム研究グループ 家畜ゲノム研究チーム
• 協力分担関係: ＳＴＡＦＦ研究所; 東海大学
• 研究期間: 継続2001～2005
• 年度: 2003
• 摘要: ブタケモカインレセプター遺伝子およびT細胞抗原受容体δ鎖の合わせて約1Mbの塩基配列決定を行い、その遺伝子構造を明らかにした。またブタ完全長cDNAライブラリーから68,000以上の5' 末端からのESTシーケンスを得た。EST配列の解析により、6,000種類以上の独立な完全長遺伝子がライブラリー中に存在することを明らかにした。さらに、これらEST配列を用いて1,000個以上のcSNPを検出し、東洋系と西洋系ブタ品種で異なる対立遺伝子200個以上を検出した。これらの情報を公開し、有効に利用するためにデータベースを構築し、さらにそれをWeb上から利用出来るシステムPEDE baseを作成した。
• カテゴリ: カイコ データベース 品種 豚