カイコの高密度遺伝地図、物理地図の作成

• 課題番号: 2003003950
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 ゲノム研究グループ 昆虫ゲノム研究チーム; 農業生物資源研究所 昆虫生産工学研究グループ 上席研究官４
• 協力分担関係: （株）ジーエヌアイ; クミアイ化学（株）; 日産化学（株）; 日本化薬（株）; タカラバイオ（株）; ＳＴＡＦＦ研究所; 北海道大学大学院; 九州大学大学院
• 研究期間: 継続2001～2005
• 年度: 2003
• 摘要: 新たにカイコホールゲノムショットガンシーケンシングを行い、約21万個のシーケンスコンティグ、全ゲノムの約80％に相当する塩基配列を得た。80,000個のBACクローンのフィンガープリントを終了し、ESTをマーカーとしたハイブリ法の結果と合わせて、カイコゲノムの65％をカバーするBACコンティグを得た。2,477個のBACクローンを含む357個のBACコンティグを染色体上にマップした。カイコESTデータベースは現在約53,000 ESTを収集し、カイコ全遺伝子の70％をカバーしている。カイコ遺伝資源について、保存系統のデータベースの英語版を作成し、公開した。育種素材系統のデータベ－ス化のため、形質データの解析・整理を行った。
• カテゴリ: 育種 遺伝資源 カイコ データベース 豚