カイコの高密度遺伝地図、物理地図の作成（Ａ１３２）

• 課題番号: 2004005119
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 ゲノム研究グループ 昆虫ゲノム研究チーム
• 協力分担関係: 東京大学; クミアイ化学（株）; 日産化学（株）; 日本化薬（株）; 北海道大学; 九州大学; ＳＴＡＦＦ研究所
• 研究期間: 継続2001～2005
• 年度: 2004
• 摘要: ホールゲノムショットガンによる高精度のカイコドラフトシーケンスを得るため、BACエンドシーケンス15万リード、フォスミドエンドシーケンス5万リードを準備した。BACエンドシーケンスを用いたSNPs解析により、549個のSNPマーカーをマップした。BACコンティグについてはESTハイブリとフィンガープリントの結果を統合してデータベース化し、カイコゲノムの65％をカバーする680個のBACコンティグを検証した。現在までに3,483BACクローンを含む495個のBACコンティグを染色体へマップした。これまでに632個のESTがマップされた。カイコESTデータベースは現在85,000ESTを収集し、カイコ全遺伝子の80％をカバーしている。17,000個の独立ESTが乗ったオリゴアレイを作成し、機能研究に利用されている。
• カテゴリ: カイコ データベース 豚