2012年度   コシヒカリの良食味遺伝子に関連するメタボローム解析

2011年度   イネ戻し交雑自殖系統群を用いたメタボロームQTL解析、特異代謝物構造解析および生合成関連遺伝子の解析

2009年度   窒素同化におけるイネ葉緑体型ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ(PEPC)の役割

2009年度   葉緑体型PEPC発現抑制イネの生理解析

2007年度   イネ－ナズナFOX hunting系：有用形質の高速探索のためのモデルシステム

2007年度   イネーナズナ FOX ラインを用いた光合成に関与する変異体の単離と解析

2007年度   近赤外分光法を用いたイネ FOX ライン種子の非破壊スクリーニング法

2017年度   AtGolS2遺伝子を導入したイネは干ばつ条件下での収量性が原品種より高い

2010年度   窒素の有効利用に重要な役割を担うイネ独自の代謝経路の発見

2013-2015年   [独立行政法人科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業]   低窒素で持続可能な二酸化炭素資源化のための中心代謝バランス制御機構の解明

2011-2015年   [独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構 生物系特定産業技術研究支援センター イノベーション創出基礎的研究推進事業]   トマトの単為結果の分子機構解明

2010-2014年   [独立行政法人日本学術振興会 科学研究費助成事業]   窒素飢餓環境に対するイネの生存戦略

2007-2010年   [独立行政法人日本学術振興会 科学研究費助成事業]   ファイトケミカルゲノミクス:植物化学的多様性のゲノム基盤