2015年度   Quantitative trait loci for rice blast resistance detected in a local rice breeding population by genome-wide association mapping

2015年度   Quantitative trait loci for whiteness of cooked rice detected in improved rice cultivars in Hokkaido

2015年度   Quantitative trait loci for rice blast resistance detected in a local rice breeding population by genome-wide association mapping

2015年度   Quantitative trait loci for whiteness of cooked rice detected in improved rice cultivars in Hokkaido

2014年度   Historical changes in population structure during rice breeding programs in the northern limits of rice cultivation

2013年度   いもち圃場抵抗性遺伝子Pi60の同定

2013年度   北海道のイネ品種群の集団構造解析

2012年度   日本の超多収イネ品種に必須なインド型ゲノム領域の表現型アノテーション

2012年度   イネ多系循環交雑集団におけるゲノム構造とQTL検出力のシミュレーション

2012年度   多収性イネ品種‘たちすがた’と‘北陸193号’間交雑由来の組換え自殖系統を利用したバイオマス関連形質および成分形質のQTLマッピング

2012年度   イネ機能遺伝子データベースの構築

2012年度   日印交雑により国内育成された多収イネ品種のゲノム構造解析に適したSNPセットの作成

2011年度   イネゲノム上に分布する機能既知遺伝子とQTL領域の比較

2017年度   多収8品種の遺伝的多様性を保有する水稲多系交雑集団(JAM)

2015年度   ナス半枯病抵抗性遺伝子座の同定と育種選抜マーカーの開発

2015年度   トマトの高品質多収育種のためのゲノム情報に基づく高精度形質予測

2014年度   北海道地域で育成されたイネ品種群の遺伝的集団構造

2016-2018年   [独立行政法人科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業]   遺伝子情報に基づく表現型予測モデルの構築とコンピューターシミュレーション育種への応用

2008-2009年   [独立行政法人日本学術振興会 科学研究費助成事業]   イネ雑種崩壊の遺伝学的解析