ニホングリの SSR マーカーの開発と品種識別

• 担当機関: （独）農業技術研究機構 果樹研究所
• 研究期間: 2001～2005
• 研究担当者: 今井剛; 山本俊哉; 松田長生; 正田守幸; 田中孝尚（東北大）; 林建樹; 鈴木三男（東北大）; 壽和夫
• 発行年度: 2002
• 要約: クリ属では初めて、ニホングリで信頼度や多型性が高い SSR マーカーを 15 種類開発した。ニホングリ 30 品種をすべて識別することができる。本 SSR マーカーは、品種識別、親子の鑑定、選抜マーカーとして有用である。
• キーワード: ニホングリ、品種識別、SSR
• 背景・ねらい: クリはブナ科に属する果樹で、その果実や木材の利用を目的に、日本のみならずアジア、ヨーロッパ等世界の温帯地域で広く栽培されている。しかし、分子マーカーによる解析例は少なく、栽培ニホングリの遺伝的多様性について、十分に解明されていない。; 本課題では、ヒトの親子鑑定に広く利用されている信頼性や多型性の高い SSR マーカー(Simple Sequence Repeat、別名マイクロサテライト)を開発し、それを用いてクリ栽培品種の解析を行った。
• 成果の内容・特徴: 1.; ニホングリ品種「筑波」のゲノム DNA をもとに、(AG)/(TC)反復配列を含む 15 種類の SSR マーカーを開発した（図１、表１）。; 2.; SSR マーカーを用いて、クリ品種「筑波」(F1)とその両親である「岸根」(♀)と「芳養玉」(♂)、及び「丹沢」(F1)とその両親である「乙宗」(♀)と「大正早生」(♂)でバンドの遺伝を調べたところ、両親のバンドが矛盾なく子供に遺伝する。このことから、親子鑑定に利用可能であることが示唆される。; 3.; 15 種類の SSR マーカーを用いて、ニホングリ 30 品種・系統のすべてが識別できる。対立遺伝子数、ヘテロ接合度とも高く、ニホングリではヘテロ性が高く、遺伝的多様性に富んでいる（表１）。; 4.; ニホングリとチュウゴクグリ間では明確な差が見られたが、日本由来の栽培品種、日本の自生グリ、韓国由来の栽培品種、韓国の自生グリ間で、明確な差は見られなかった。; 5.; SSR マーカーのほとんどが、チュウゴクグリ、ヨーロッパグリ、アメリカグリ等の他種のクリに適用可能である。
• 成果の活用面・留意点: 1.; 信頼度の高いクリの品種識別が可能である。; 2.; クリの親子鑑定に利用できる。
• カテゴリ: くり 品種