| タイトル |
ゲノム・スキャニング（ＲＬＧＳ）法によるイネ品種のＤＮＡフィンガープリント |
| 担当機関 |
四国農業試験場 |
| 研究期間 |
1994～1994 |
| 研究担当者 |
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| 発行年度 |
1994 |
| 要約 |
イネから抽出したＤＮＡをゲノム・スキャニング（ＲＬＧＳ）法の二次元電気泳動によって解析した。品種の比較では、日本晴とコシヒカリを正確に区別でき，新しいＤＮＡフィンガープリントとしてきわめて有効である。
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| 背景・ねらい |
品種の同定・識別技術は，植物ゲノム研究の進展にともないＤＮＡ多型が利用され始めている。しかし，制限酵素断片長多型（ＲＦＬＰ）や特定ＤＮＡ断片の増幅を行うＰＣＲ法は多数の遺伝子座を一度に解析することには適しておらず，同じ実験操作を繰り返す必要がある。そこで，ゲノム・スキャニング法に着目し，イネ品種に対して新しいＤＮＡフィンガープリントとして利用できることを明らかにした。
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| 成果の内容・特徴 |
- イネＤＮＡ５μｇをNotＩで消化，端部をＲＩで標準化，EcoＲＶで消化し，そのうち1.5μｇをアガロース・ゲル電気泳動（１次元目）し，ゲルのままMboＩで消化し，アクリルアミド・ゲル電気泳動（２次元目）した。ゲルを乾燥後オートラジオグラフィーでＸ線フィルムに感光させ，３，０００個以上のスポットを得た。
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１次元目（１−Ｄ）ではＤＮＡ断片長約９ｋｂｐから５００ｂｐ，２次元（２−Ｄ）ではおよそ２ｋｂｐから１００ｂｐの範囲で分離した。
- 遺伝的に遠縁のインディカ品種とジャポニカ品種との比較では，スポット同士の対応がつきにくい程異なったパターンを示した。インディカ在来品種「柳州包芽早」とジャポニカ型品種「日本晴」との間では，ＲＬＧＳパターンに基づく遺伝的な近縁度は０．３４４であった。
- 遺伝的に近縁のジャポニカ品種同士の比較では，きわめて類似したパターンを示した。「日本晴」と「コシヒカリ」の間では，遺伝的な近縁度は０．９８０であった。逆にいえば，きわめて近縁の品種間でもゲノム・スキャニング法によって明確に識別できた。
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| 成果の活用面・留意点 |
- ゲノム・スキャニング法は少量のＤＮＡ試料を用いて品種同定・識別に利用が可能であり，イネ以外の作物にも応用可能と考えられる。
- 実際の品種同定のためには，各品種のＲＬＧＳパターンのデータベースの構築が必要であり，画像データを処理するための装置やソフトウェアが必要となる。
図
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| 図表1 |
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| カテゴリ |
乾燥
データベース
品種
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