PCR法による土壌からのダイズ茎疫病菌の検出

• 担当機関: 福井農試
• 研究期間: 2001～2005
• 研究担当者: 古河 衞; 景山幸二（岐阜大流域研セ）; 浅野貴博（岐阜大流域研セ）
• 発行年度: 2004
• 要約: 特異的プライマーを用いたPCR法によって、土壌中のダイズ茎疫病菌の検出が可能である。
• キーワード: ダイズ、茎疫病菌、PＣR
• 背景・ねらい: 福井県では、水田転換畑でダイズが長年栽培されてきたが、近年、単収が低迷し、年次変動も極めて大きくなっている。原因として、茎疫病など土壌伝染性病害の発生も挙げられている。茎疫病の発生は、滞水や冠水を受けると被害が大きいが、同様に冠水しても発生しない圃場もあることから、圃場での病原菌の分布と密度が大きく関与していると考えられる。しかし、捕捉法による茎疫病菌の検出は、罹病苗にFusarium、Pythium属菌などが2次的に寄生するため分離が極めて難しく、また、時間、労力、熟練を必要とする。; そこで、PCR法による茎疫病菌の簡便な検出法を開発する。
• 成果の内容・特徴: １．; （茎疫病菌を含む）10属32種の病原糸状菌のrDNA-ITS領域塩基配列に基づき、茎疫病菌検出のための特異的プライマーを設計した（図1）。; ２．; 本プライマーにより、茎疫病菌では６７５ｂｐの断片が増幅されるが、その他の菌株では増幅断片が検出されない（図2）。; ３．; 土壌からの茎疫病菌の検出には、表層５cmの土壌から図3に示した方法によりDNAを抽出し、ＰＣＲ法に用いる（図3）。; ４．; PCR法では、水田転換畑等におけるダイズ茎疫病菌の分布を簡便に把握できる（図4）。
• 成果の活用面・留意点: １．; ダイズ茎疫病の迅速な診断の一助となる。; ２．; 採取した土壌を3か月間保存すると菌が死滅して検出されないことがあるため、できるだけ早期に判定を行う。
• カテゴリ: 水田 大豆