太平洋クロマグロの全ゲノムDNAの解読

• 担当機関: （独）水産総合研究センター 中央水産研究所
• 研究期間: 2009～2010
• 研究担当者: 斉藤憲治; 大原一郎; 丹羽洋智; 小林敬典; 尾島信彦; 藤原篤志; 菅谷琢磨; 中村洋路; 馬久地みゆき; 安池元重; 服部正平; 大島健志朗; 久原 哲; 田代康介
• 発行年度: 2011
• 要約: 中央水産研究所水産遺伝子解析センターでは、東京大学および九州大学と共同で、太平洋クロマグロの全ゲノムDNAの解読に成功しました。取得した配列情報はゲノムサイズの9割を超え、他の魚類のゲノム配列との比較から、データの信頼性は高いと判断された。
• 背景・ねらい: 寿司ネタなどで人気の高い本マグロ（クロマグロ）の天然資源は低迷しており、それに呼応するように養殖が盛んになってきている。そのクロマグロのゲノム（細胞の中にある全ての遺伝情報）をすべて解読することは、マグロという生物を遺伝子レベルで解明するという基盤的な研究に加え、養殖用として優れた形質を備えたもマグロ種苗の改良、遺伝情報を手がかりにした高度な資源管理や、未知の有用な生理活性物質の発見などにつながる、革新的技術開発の起爆剤になると期待される。
• 成果の内容・特徴: 1度に膨大なDNA塩基配列データをはき出す次世代シーケンサーを駆使し、約8億塩基と見積もられているクロマグロのゲノムの10倍以上のデータを取って、コンピュータ上でつなぎ合わせて塩基配列を再構成した。その総延長はゲノムサイズの9割を超え、そのデータから遺伝子領域を検索したところ、すでにゲノム解読が行われているメダカなど他の魚類にみられる遺伝子が同様に見つかった。このことから、再構成された配列は、ゲノム全体をほぼカバーしていると考えられた。太平洋クロマグロの全ゲノム配列の中には、太平洋を何度も横断することができるほどの高度な遊泳能力に関係する遺伝子や、養殖種苗として有用な、早い成長や耐病性などの形質と関連する遺伝子が含まれているものと期待される。
• 成果の活用面・留意点: 今後、クロマグロのゲノム配列情報の精度を上げるとともに、養殖や資源管理などの技術革新につながる研究に発展させる。平成23年度から水産庁の委託事業として、「クロマグロ養殖最適親魚選抜・確保技術開発委託事業」がスタートし、高生残、成熟関連、耐病性関連の遺伝子マーカーの探索が行われている。
• 研究内容: http://fra-seika.fra.affrc.go.jp/~dbmngr/cgi-bin/search/search_detail.cgi?RESULT_ID=3263&YEAR=2011