SSRマーカーによる日本のパインアップル品種のDNA品種識別

タイトル	SSRマーカーによる日本のパインアップル品種のDNA品種識別
担当機関	（独）農業・食品産業技術総合研究機構果樹研究所
研究期間	2010～2012
研究担当者	山本俊哉正田守幸浦崎直也崎山澄寿寺上伸吾保坂ふみ子滋田徳美西谷千佳子
発行年度	2012
要約	パインアップルで開発した18種類のSSRマーカーにより、沖縄県で育成された7品種を含む合計30のパインアップル品種・系統のDNA品種識別が可能である。
キーワード	パインアップル、SSRマーカー、DNA品種識別
背景・ねらい	パインアップル(Ananas comosus (L.) Merr.)は、熱帯アメリカ原産のパイナップル科の多年草で、その生産はバナナとカンキツ類に次ぐ主要熱帯果樹として位置付けられる。日本では沖縄県が主産地であり、沖縄県農業研究センターから高品質の生食用パインアップル7品種が育成・品種登録されている。栄養繁殖性作物では登録品種の権利侵害が危惧されるため、高精度DNAマーカーによるDNA品種識別技術の開発が進められている。そこで本研究では、利用可能な高精度DNAマーカーが少なく、DNA品種識別技術が確立されていないパインアップルについて、SSR (simple sequence repeat)マーカーの開発とそれを利用したDNA品種識別技術の確立に取り組む。
成果の内容・特徴	濃縮ゲノムライブラリ法により、パインアップル品種「N67-10」から作製した18種類のマーカーは、品種間で明瞭な増幅を示し品種識別に適する。開発したSSRマーカーは多型性が高く、マーカーあたり3～7個の対立遺伝子(平均4.1)を持ち、ヘテロ接合度の期待値は0.09-0.76(平均0.52)である。供試したパインアップル30品種・系統は、18種類のSSRマーカーで識別が可能である(図1)。
成果の活用面・留意点	開発したSSRマーカーは、沖縄県で育成されたパインアップル7品種「N67-10」、「ゴールドバレル」、「ハニーブライト」、「ジュリオスター」、「ソフトタッチ」、「サマーゴールド」、「ゆがふ」の育成者権保護に利用可能である。突然変異によって生じた品種と原品種は、本マーカーセットの遺伝子型が同一であり、マーカーによる識別はできない。 SSRマーカーの解析と遺伝子型の判定には、DNAシーケンサーを用いるのが望ましい。
図表1
研究内容	http://www.naro.affrc.go.jp/project/results/laboratory/fruit/2012/142g0_01_17.html
カテゴリ	DNAマーカーパイナップルバナナ繁殖性改善品種その他のかんきつ