タイトル | キク栽培品種を利用した網羅的EST解析 |
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担当機関 | (国研)農業・食品産業技術総合研究機構 野菜花き研究部門 |
研究期間 | 2011~2017 |
研究担当者 |
佐々木克友 光田展隆 奈島賢児 岸本久太郎 片寄裕一 金森裕介 大宮あけみ |
発行年度 | 2017 |
要約 | キク栽培品種「セイマリン」由来の発現遺伝子配列断片(expressed sequence tag、EST)情報の網羅的解析により構成された213,204個の相同連結配列(コンティグ)情報をキクのゲノム育種研究のための基盤情報として公共データベース上で公開している。 |
キーワード | キク、EST、コンティグ、データベース |
背景・ねらい | キクでは主に、交配育種や突然変異育種によって新品種が作出されている。一方、様々な植物種においてDNAマーカー育種が進みつつあり、また近年のゲノム編集技術の急速な進展により、今後はゲノム編集技術を利用した育種も期待されている。これら次世代の育種技術には遺伝子配列情報が不可欠であるが、キクは6倍体かつゲノムサイズが12Gbp以上と大きく、また栽培品種も非常に多いことから、配列情報の整備が進み難くゲノム育種研究のための遺伝子配列情報が不足している。一方で、年々、次世代シークエンスの性能の進展や低価格化が進んでおり、今後はキクにおいてもゲノム育種研究の情報を利用した新品種開発が進展することが期待される。本研究では、キクにおけるゲノム育種研究の発展に資する配列情報を提供することを目的に、発現遺伝子配列断片(expressed sequence tag、EST)情報を網羅的に解読する。 |
成果の内容・特徴 |
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成果の活用面・留意点 |
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研究内容 | http://www.naro.affrc.go.jp/project/results/4th_laboratory/nivfs/2017/nivfs17_s06.html |
カテゴリ | 育種 きく ゲノム育種 新品種 データベース DNAマーカー 品種 品種改良 |