SSRマーカーを利用した小豆・菜豆の品種判別

タイトル	SSRマーカーを利用した小豆・菜豆の品種判別
担当機関	遺伝資源部
研究期間	2003～2005
研究担当者	加賀秋人紙谷元一竹内　徹田澤暁子冨田謙一
発行年度	2006
要約	小豆のSSRマーカー5種で「きたのおとめ」、「しゅまり」と国内品種および海外遺伝資源、菜豆のSSRマーカー5種で「福勝」、「福良金時」と他の金時品種、また「絹てぼう」と他の手亡品種の判別が可能である。
キーワード	小豆、菜豆、品種判別、SSRマーカー
背景・ねらい	近年、低価格な農産物の輸入増加に伴い、評価の高い国内育成品種が海外に流出し、海外産として輸入される事例が認められる。農産物の適正な表示を担保し、登録品種の育成者権を保護するためには、迅速で精度の高い品種判別法を確立する必要がある。　北海道立中央農試では、RAPD-STSマーカー3種による菜豆の手亡品種および小豆の品種判別法を開発した（2002）が、多種多様な遺伝子型をもつ輸入小豆を対象にした場合には3種のRAPD-STSマーカーのみでは識別性が十分でないため、多型性の高いマーカーによって信頼性を向上させる必要がある。一方、SSRマーカーはRAPD-STSマーカーに比較して多型性が高いとされる。農業生物資源研究所において小豆SSRマーカーの開発が進められ、菜豆のSSRマーカーはカナダで報告がある。多型性の高いSSRマーカーを利用して、小豆及び菜豆の品種判別法を検討する。
成果の内容・特徴	小豆のSSRマーカー5種により、登録品種「きたのおとめ」、「しゅまり」と他の小豆品種との判別が可能である。RAPD-STSマーカーで区別できない品種間の判別も可能である（表1）。 SSRマーカーによる判別では、海外（中国、韓国、台湾）の小豆遺伝資源239点に「きたのおとめ」、「しゅまり」と同じ遺伝子型を示す遺伝資源は認められない。中国からの輸入小豆は雑多な遺伝子型の混合集団である（表1）。菜豆のSSRマーカー5種により登録品種「福勝」、「福良金時」と他の金時品種、「絹てぼう」と他の手亡品種の判別が可能である（表2）。
成果の活用面・留意点	本成果は輸入豆類等の品種判別に利用できるが、輸入小豆は品種が混合されているため、含まれる品種の判別には複数の粒を個別に調査する必要がある。精度の高いPCR増幅DNA断片長の解析にはシークエンサー導入が望ましい。本成果の一部をマニュアル化して、農林水産省生産局種苗課のホームページに公開している（http://www.hinsyu.maff.go.jp/）。
図表1
図表2
カテゴリ	遺伝資源品種