アブラナ科野菜におけるマイクロサテライトマーカーの開発

• 担当機関: 野菜・茶業試験場
• 研究期間: 2000～2001
• 研究担当者: 諏訪部圭太; 池谷祐幸; 平井正志
• 発行年度: 2000
• 要約: 〔要約〕Brassica rapaゲノミックライブラリーよりマイクロサテライト領域を含む５８個のクローンを単離し、ち３８個についてＰＣＲマーカーを開発した。これらのマーカーはおのおの１遺伝子座を認識し、品種間で際だった多型が見いだされる。
• キーワード: Brassica rapa 、マイクロサテライト、ＰＣＲマーカー野菜・茶業試験場 野菜育種部 育種法研究室
• 背景・ねらい: マイクロサテライトマーカーはゲノム中における遍在性や著しい多型性などのため、極めて汎用性の高い分子マーカとして注目されている。しかしその開発には多大な時間と労力を要するため、アブラナ科野菜で利用可能なものはごく少ない。そこでゲノミックライブラリーからのスクリーニング法により、多数のマイクロサテライトを単離・開発する。

成果の内容・特徴

1. アブラナ科野菜の一種のBrassica rapaゲノムライブラリーからのスクリーニングでマイクロサテライト領域を含む５８個のクローンを単離し、うち３８個についてはプライマーを設計し、ＰＣＲマーカーとした。
   
2. B. rapa様々なタイプを代表する７つの品種群より選んだ１９品種で多型解析を行ったところ、ほとんどのプライマーで多型が検出される（図１）。増幅バンドは１～２本であるので、１遺伝子座を認識し、共優性であることが示唆される。
   

成果の活用面・留意点

1. 開発されたマイクロサテライトマーカーは、異なる集団で作成した別々の連鎖地図上にある同じ遺伝子座を示すアンカーマーカーになり、連鎖地図の統合に大きな威力を発揮しうる。
   
2. どのような交配集団においても多型を示す可能性が強く、連鎖地図作成や選抜マーカーとしての利用価値も高い。
   

• カテゴリ: あぶらな 育種 茶 品種