測定・分析技術[分析・データ管理技術] and [データベース or データ管理]
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摘要 インターネット上では多くの生物情報が無数のWWWサーバから公開されているが、的確に情報収集することが困難である。本課題では、種々雑多なインターネット情報の中から、生物系資材情報のみを選択的かつ...
摘要 近年の組換え遺伝子および遺伝子治療のための有効なウイルスベクターの開発研究の進歩に伴い、高発現能力を有し、広範囲な遺伝子導入が可能なウイルスが注目を集めており、これら情報をデータベース化するこ...
農山漁村地域の国土空間データ基盤構築高度化手法の策定およびその情報解析への応用(33)
摘要 傾斜地域農業における様々な地域資源情報を地図情報データベース化するために、国土地理院が発行している25000分の1地形図から等高線・河川湖沼・道路・鉄道等のベクトルデータ入力を効率的に行う手法...
摘要 文字や数値だけのデータでは、生物資源の多様性を十分に表現できないため、画像等のバイナリデータを遺伝資源データベースに統合する。6年度は、植物の種子カードを画像データとして植物遺伝資源データベー...
摘要 ジーンバンクデータ管理用計算機システムの更新に伴い、データベースの新システムへの移行を行うとともに、これまで開発したプログラムについて、OSの変更に対応可能とするよう書き直しを行った。また、デ...
摘要 特性データべース管理システムを開発し、特性データベースを構築する。また、今後の利用形態に合わせ、画像などの新しいデータベースシステムの開発と構築を行った。また、「データベース化のための動物遺伝...
探索・収集情報を元にした微生物遺伝資源の天然での所在情報の解析(72)
摘要 過去の探索・収集・調査活動での野帳や研究資料等、糸状菌種の分離採取情報を一元的に統合し、菌種ごとの所在情報を蓄積・解析するため、11年度はMS Excelのスプレッド・シート上に共通フォーマットを考案し...
摘要 近年、組換え遺伝子工学の発展に伴い、高発現能力を有し、かつ広範囲な宿主に対して遺伝子導入が可能なウイルスベクターが注目されている。本課題では利用価値の高い組換えウイルスデータベースを構築するた...
摘要 微生物遺伝資源に関する画像データには、微生物の顕微鏡写真や、データシートなどが含まれる。特性データ用データシートは、文字データだけでは表現することが困難な遺伝資源の特性を、図表を用いて表してい...
摘要 生物資源データの1つであるウイルスデータは、多くの情報が蓄積されつつあるが、利用頻度の高い組換えウイルスについての情報を持つ機関が存在していない。本プロジェクトは、組換えウイルスおよびそれらの...
摘要 リレーショナルデータベースモデルによりスキーマを作成し、INFORMIX-ONLINEをデータベースエンジンとして、INFORMIX-ESQL/C及び4GLを開発ツールとして微生物遺伝資源デー...
摘要 パスポートデータベースについては、データの入力、点検を行った。またすでに公開しているパスポートデータの点検・修正を行った。また公開用データベースを構築している農林水産研究計算センターのデータベ...
摘要 リレーショナルデータモデルによりスキーマを開発しINFORMIX-ONLINEをデータベースエンジンとして、INFORMIX-ESOL/C及び4GL等を開発ツールに用いて、パスポートデータ検索...
摘要 植物遺伝資源の2次特性、3次特性、微生物遺伝資源の特性評価データは、通常のリレーショナルデータベースの表として管理すると欠測値が非常に多く、効率的な管理が出来ない。このため、従来のデータのみの...
摘要 9年度までは、微生物遺伝資源とDNA在庫管理データベースで非正規形データを効率的に管理するためのスキーマの設計と、管理用プログラムの開発を行った。10年度は、植物遺伝資源の特性データの非正規形...
摘要 センターバンク、サブバンクに分散保存されている植物遺伝資源に対応した分散データ管理手法を開発した。セキュリティ維持機構として、外部のネットワークから隔離したセンターバンクのデータベースを、サブ...
摘要 地すべり地を管理するために導入されている自動観測システムは、各社独自の仕様を用いているため、システム間でデータの互換性をもたせるのは困難なことが多い。このため、短期的に現存の観測システムを統合...
摘要 動物遺伝資源特性調査マニュアルを改訂するための作業を行った。調査項目の整理をおこない、各項目についてどの程度記入可能か調査した。また、蚕を中心に一次特性項目について記入を開始した。パスポートデ...
遺伝子情報の編集と育種的利用のための情報処理システムの開発(56)
摘要 生物資源データは、対象とする生物種、データのカテゴリーが多く、データ量も大きい。とくにゲノムプロジェクトの研究成果などを受け、農業生物分野でのデータ構築は盛んである。現在、DNA塩基配列情報の...
摘要 DNA在庫管理データベースの非正規形データを効率的に管理するためのスキーマは、座位を管理する表「locus」に、列「表コード」と列「主キー値」を有し、表コード(データベース中のすべての表に割り...