ブタの高密度遺伝地図、物理地図の作成（Ａ１３１）

• 課題番号: 2004005118
• 研究機関名: 農業生物資源研究所
• 研究分担: 農業生物資源研究所 ゲノム研究グループ 家畜ゲノム研究チーム
• 協力分担関係: ＳＴＡＦＦ研究所; 東海大学; 宮城県畜産試験場; 岐阜県畜産研究所; 北海道大学; 北里大学; 東北大学
• 研究期間: 継続2001～2005
• 年度: 2004
• 摘要: 昨年度までに1,288個のマーカーからなる物理地図を構築した。ブタ完全長cDNAライブラリーに基づくESTを、公開済みの68,000配列に加えて、70,000個追加し、内52,000個についてはPEDEデータベースを通じた新規公開を行った。この中には肺胞マクロファージ等の感染防御に関わる細胞集団のライブラリーが含まれる。さらにcSNPについても昨年までの1,000個に加えて、500個を検出した。遺伝子全長の解読のためにEST代表クローン5,546個を選抜し、その3'末端からの解読を行った。それらのcDNAクローンの中でブタMHC及びTCRをコードするもの124個について完全解読を完了した。またブタ拡張MHCクラスII領域、CD1領域等約1Mbのブタゲノム領域の解読を行った。
• カテゴリ: カイコ データベース 豚