タイトル |
ばれいしょの病害虫抵抗性遺伝子を選抜するDNAマーカー |
担当機関 |
道立中央農試 |
研究期間 |
2004~2008 |
研究担当者 |
竹内徹
佐々木純
鈴木孝子
堀田治邦
樋浦里志
池谷聡
藤田涼平
千田圭一
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発行年度 |
2008 |
要約 |
DNAマーカーによって、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを判定できる。
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キーワード |
ジャガイモシストセンチュウ、ジャガイモYウイルス、抵抗性遺伝子、DNAマーカー
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背景・ねらい |
ばれいしょの病害虫抵抗性品種を早期に育成するために、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを検出するDNAマーカーを開発する。現在、実用的なDNAマーカーはないことから、高精度で使いやすいマーカーの開発をめざす。
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成果の内容・特徴 |
- DNAマーカーによって、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを判定できる(表1)。PCR反応は、HotStar Taq DNA Polymerase(QIAGEN)を利用する。アニーリング温度は55℃とする。
- H1遺伝子、Rychc遺伝子ともに、遺伝子の両側を挟む2マーカーを同時に増幅することにより、精度よく検定できる。また、ばれいしょの顆粒性澱粉合成酵素遺伝子GBSSを検出するプライマーペアを追加し、必ず981bpの増幅断片が得られるように設計することでPCR作業エラーによる誤判定を回避できる(図1)。
- 一個体から抽出したDNAでシストセンチュウおよびYウイルス抵抗性遺伝子のマーカー検定に利用できるため、効率的である。
- 検定期間は、従来法ではシストセンチュウおよびYウイルスともに2~3か月間を要したが、DNAマーカー検定では1日に200点程度を処理できる。
- 検定試料は、従来法では休眠を打破した塊茎が必要であるが、DNAマーカー検定では葉に加え、塊茎からのDNA抽出法(表2)も確立したため、検定は通年で実施可能である。
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成果の活用面・留意点 |
- 本研究で開発したDNAマーカー検定法は、ばれいしょの品種改良における選抜に活用できる。
平成20年度北海道農業試験会議(成績会議)における課題名および区分 「ばれいしょの病害虫抵抗選抜に有効なDNAマーカー」(研究参考)
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図表1 |
![214060-1.jpg](https://s3-agre-content.s3.ap-northeast-1.amazonaws.com/assets/images/seika_chart/214060-1.jpg?X-Amz-Content-Sha256=UNSIGNED-PAYLOAD&X-Amz-Security-Token=IQoJb3JpZ2luX2VjEC0aDmFwLW5vcnRoZWFzdC0xIkgwRgIhALteNKBElgaP5nzspKmiQx%2BgPe7o884LLOjz9rAjqKPJAiEAwLFPIf0waxGQnF3aPS4dmWdRt5oiyzWqI4boTKVWNmsqmQQI1%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2FARACGgw1MzIzMzEwNzIwNDEiDGoFgX2trGR85ZHIiCrtA%2FQrU3mW9k%2FjXjFbRE8tB3nG1Idmhr2GVaTeZobFo72uNzJRzjAw0fsU1mtl7jCH9GydBhmqOZMBf135%2FwL2zl60KERguIpAdwJSnCmkGS8sIIO07T5NygpFySMZ3oSTvU1mEF7sTckcavhlyMshJ2DSIvVmimhH5Je24xowkKnS3zFIbokjZFY7RbCs5AMryxqc1UfD43iS9BEgmr90SOIn8Za7ocQ1NsGoF17mrDayumiEUc%2BKuhvKUmQkaLIo%2Fcry329nx0YumUsLalcw7SIjmQUJwbFb9VTC6450qoXKpkzr1%2BHSauCSGRFsZDaoXNr04av7rDnSkWUwklS1sdACJDlTu%2BoGLoi5AzfTlu9oqtghA7BE%2FJk8aJmAuO%2FUEbbRumhADGK60G7w5x4WY%2B0%2BrC5kqAiJ2eUxsLsQ%2BlXbqFvgHf2g6iYFTNFurcP3Lb6Cs3lTKS76j6ROufpBYAAEps%2BgBdoViRpag5SQcYppjD68jDHbwltJ1dlI1FYeXwLhDsF8xsIz1fHb%2Bda9aIJpJKoXlNhdNgGV49JbM25AAsfVLTzi%2BJQfJwqYjqO1LeKqYXzCpoJBOi%2FLtBWbK%2Fszk7PjuP0H0G9HeQkz1TXmBHjm3MluQG7D9Mgu2FTXrpavJyyyRtsw%2BOY4xs0wvbLwswY6pQF%2BHeDiX1ibJE2rtVlzIfAcdrT5b65BRWynh%2FE5obKMwdPkNhC%2BCsFaMlF%2FWlkHBzcYiUNWGxEu7Ed2W6u6W%2B8HkjvqycdZz3NSaglr2Y%2BO0BGq74rsSolwr%2FIc%2Fs%2FOVBeTSPeJUmKGTe5pvurwZYRZpFOr7bGiqyi64jJstHKFORuUt8DM%2BwEDb2AjrrIf%2FSCwUJlaizE%2FWwlkZSwHxIRUixmTxOw%3D&X-Amz-Algorithm=AWS4-HMAC-SHA256&X-Amz-Credential=ASIAXX4LHRIUQJB53EFJ%2F20240626%2Fap-northeast-1%2Fs3%2Faws4_request&X-Amz-Date=20240626T135535Z&X-Amz-SignedHeaders=host&X-Amz-Expires=1800&X-Amz-Signature=5862b45f30bc77f86c56845f4179b2069eb47dce86893d91ea7350f0727ef8f6) |
図表2 |
![214060-2.jpg](https://s3-agre-content.s3.ap-northeast-1.amazonaws.com/assets/images/seika_chart/214060-2.jpg?X-Amz-Content-Sha256=UNSIGNED-PAYLOAD&X-Amz-Security-Token=IQoJb3JpZ2luX2VjEC0aDmFwLW5vcnRoZWFzdC0xIkgwRgIhALteNKBElgaP5nzspKmiQx%2BgPe7o884LLOjz9rAjqKPJAiEAwLFPIf0waxGQnF3aPS4dmWdRt5oiyzWqI4boTKVWNmsqmQQI1%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2FARACGgw1MzIzMzEwNzIwNDEiDGoFgX2trGR85ZHIiCrtA%2FQrU3mW9k%2FjXjFbRE8tB3nG1Idmhr2GVaTeZobFo72uNzJRzjAw0fsU1mtl7jCH9GydBhmqOZMBf135%2FwL2zl60KERguIpAdwJSnCmkGS8sIIO07T5NygpFySMZ3oSTvU1mEF7sTckcavhlyMshJ2DSIvVmimhH5Je24xowkKnS3zFIbokjZFY7RbCs5AMryxqc1UfD43iS9BEgmr90SOIn8Za7ocQ1NsGoF17mrDayumiEUc%2BKuhvKUmQkaLIo%2Fcry329nx0YumUsLalcw7SIjmQUJwbFb9VTC6450qoXKpkzr1%2BHSauCSGRFsZDaoXNr04av7rDnSkWUwklS1sdACJDlTu%2BoGLoi5AzfTlu9oqtghA7BE%2FJk8aJmAuO%2FUEbbRumhADGK60G7w5x4WY%2B0%2BrC5kqAiJ2eUxsLsQ%2BlXbqFvgHf2g6iYFTNFurcP3Lb6Cs3lTKS76j6ROufpBYAAEps%2BgBdoViRpag5SQcYppjD68jDHbwltJ1dlI1FYeXwLhDsF8xsIz1fHb%2Bda9aIJpJKoXlNhdNgGV49JbM25AAsfVLTzi%2BJQfJwqYjqO1LeKqYXzCpoJBOi%2FLtBWbK%2Fszk7PjuP0H0G9HeQkz1TXmBHjm3MluQG7D9Mgu2FTXrpavJyyyRtsw%2BOY4xs0wvbLwswY6pQF%2BHeDiX1ibJE2rtVlzIfAcdrT5b65BRWynh%2FE5obKMwdPkNhC%2BCsFaMlF%2FWlkHBzcYiUNWGxEu7Ed2W6u6W%2B8HkjvqycdZz3NSaglr2Y%2BO0BGq74rsSolwr%2FIc%2Fs%2FOVBeTSPeJUmKGTe5pvurwZYRZpFOr7bGiqyi64jJstHKFORuUt8DM%2BwEDb2AjrrIf%2FSCwUJlaizE%2FWwlkZSwHxIRUixmTxOw%3D&X-Amz-Algorithm=AWS4-HMAC-SHA256&X-Amz-Credential=ASIAXX4LHRIUQJB53EFJ%2F20240626%2Fap-northeast-1%2Fs3%2Faws4_request&X-Amz-Date=20240626T135535Z&X-Amz-SignedHeaders=host&X-Amz-Expires=1800&X-Amz-Signature=48c9921549407eec7e79e96b6396638f51bd747e86a638e5cd047c2e823a4a7f) |
図表3 |
![214060-3.jpg](https://s3-agre-content.s3.ap-northeast-1.amazonaws.com/assets/images/seika_chart/214060-3.jpg?X-Amz-Content-Sha256=UNSIGNED-PAYLOAD&X-Amz-Security-Token=IQoJb3JpZ2luX2VjEC0aDmFwLW5vcnRoZWFzdC0xIkgwRgIhALteNKBElgaP5nzspKmiQx%2BgPe7o884LLOjz9rAjqKPJAiEAwLFPIf0waxGQnF3aPS4dmWdRt5oiyzWqI4boTKVWNmsqmQQI1%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2F%2FARACGgw1MzIzMzEwNzIwNDEiDGoFgX2trGR85ZHIiCrtA%2FQrU3mW9k%2FjXjFbRE8tB3nG1Idmhr2GVaTeZobFo72uNzJRzjAw0fsU1mtl7jCH9GydBhmqOZMBf135%2FwL2zl60KERguIpAdwJSnCmkGS8sIIO07T5NygpFySMZ3oSTvU1mEF7sTckcavhlyMshJ2DSIvVmimhH5Je24xowkKnS3zFIbokjZFY7RbCs5AMryxqc1UfD43iS9BEgmr90SOIn8Za7ocQ1NsGoF17mrDayumiEUc%2BKuhvKUmQkaLIo%2Fcry329nx0YumUsLalcw7SIjmQUJwbFb9VTC6450qoXKpkzr1%2BHSauCSGRFsZDaoXNr04av7rDnSkWUwklS1sdACJDlTu%2BoGLoi5AzfTlu9oqtghA7BE%2FJk8aJmAuO%2FUEbbRumhADGK60G7w5x4WY%2B0%2BrC5kqAiJ2eUxsLsQ%2BlXbqFvgHf2g6iYFTNFurcP3Lb6Cs3lTKS76j6ROufpBYAAEps%2BgBdoViRpag5SQcYppjD68jDHbwltJ1dlI1FYeXwLhDsF8xsIz1fHb%2Bda9aIJpJKoXlNhdNgGV49JbM25AAsfVLTzi%2BJQfJwqYjqO1LeKqYXzCpoJBOi%2FLtBWbK%2Fszk7PjuP0H0G9HeQkz1TXmBHjm3MluQG7D9Mgu2FTXrpavJyyyRtsw%2BOY4xs0wvbLwswY6pQF%2BHeDiX1ibJE2rtVlzIfAcdrT5b65BRWynh%2FE5obKMwdPkNhC%2BCsFaMlF%2FWlkHBzcYiUNWGxEu7Ed2W6u6W%2B8HkjvqycdZz3NSaglr2Y%2BO0BGq74rsSolwr%2FIc%2Fs%2FOVBeTSPeJUmKGTe5pvurwZYRZpFOr7bGiqyi64jJstHKFORuUt8DM%2BwEDb2AjrrIf%2FSCwUJlaizE%2FWwlkZSwHxIRUixmTxOw%3D&X-Amz-Algorithm=AWS4-HMAC-SHA256&X-Amz-Credential=ASIAXX4LHRIUQJB53EFJ%2F20240626%2Fap-northeast-1%2Fs3%2Faws4_request&X-Amz-Date=20240626T135535Z&X-Amz-SignedHeaders=host&X-Amz-Expires=1800&X-Amz-Signature=730c1067646758e596c4634c39abe17989442dc18faf2f603503e8d29e63ab16) |
カテゴリ |
害虫
DNAマーカー
抵抗性遺伝子
抵抗性品種
ばれいしょ
品種改良
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