SSRマーカーによるニホングリのDNA品種識別技術

タイトル	SSRマーカーによるニホングリのDNA品種識別技術
担当機関	（独）農業・食品産業技術総合研究機構果樹研究所
研究期間	2006～2007
研究担当者	山本俊哉西谷千佳子寺上伸吾今井剛佐藤明彦澤村豊高田教臣平林利郎
発行年度	2007
要約	ニホングリやヨーロッパグリで開発された12種類のSSRマーカーを用いて、60の主要なニホングリ品種の識別が可能である。また、本SSRマーカーを用いて、親子関係の確認が可能である。
キーワード	ニホングリ、DNAマーカー、品種識別
背景・ねらい	ニホングリでは、最近「ぽろたん」などの優良な品種が育成されているが、今後の普及や栽培の加速化に伴って、権利侵害や海外への違法な流出、さらに海賊版果実の流入が危惧される。そこで、ニホングリを対象に品種識別に利用可能なDNAマーカーの開発、およびDNAマーカーを用いた科学的な信頼度の高い識別方法の開発を図る。
成果の内容・特徴	１．「筑波」、「丹沢」、「石鎚」、「伊吹」、「国見」、「紫峰」、「秋峰」、「ぽろたん」、「岸根」、「銀寄」、「大峰」、「利平ぐり」、「中生丹波」、「笠原早生」、「乙宗」、「大正早生」、「芳養玉」、「豊多摩早生」、「銀鈴」など果樹研究所に植栽されている主要なニホングリ60品種で、SSRマーカーによる品種識別が可能である。２．ニホングリ由来の7種類のSSRマーカー（KT001b、KT004a、KT005a、KT015a、KT020a、KT029a、KT030a）、ヨーロッパグリ由来の5種類のSSRマーカー（CsCAT18、CsCAT24、EMCs2、EMCs13、EMCs14）の合計12種類のSSRマーカーが、品種識別に利用可能である（表１）。３．SSRマーカーによって「筑波」、「丹沢」、「石鎚」、「国見」、「紫峰」、「秋峰」、「ぽろたん」の親子関係の確認が可能である（表２）。４．「雲竜」は「筑波」の枝変わり品種であるが、「筑波」と同じSSR遺伝子型を示したため、枝変わりと確認される（表２）。同一SSR遺伝子型を示す５組の品種が存在する（表２）。
成果の活用面・留意点	１．枝変わり品種と原品種の品種識別について、遺伝子型が同一であるため本マーカーは利用できない。２．同一SSR遺伝子型を示す品種は、異名同品種の可能性が予想される。３．本DNA品種識別技術では、様々な組織を用いることが可能である。母親由来の組織である葉、鬼皮、座、渋皮から抽出したDNAは、母親と同じ遺伝子型を示す。一方、子葉から抽出したDNAは、母親と父親の交雑F1世代であり、両親の対立遺伝子を併せ持つため、分析に際して注意を要する。
図表1
図表2
カテゴリ	DNAマーカー品種