測定・分析技術[分析・データ管理技術] and [データベース]
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北海道周辺に分布するニシンの遺伝情報を利用した集団構造解析技術開発 Ⅰ
摘要 北海道周辺に分布するニシンの系群について、産卵期に産卵場で採集された産卵親魚のmtDNA 分析を行って遺伝的特徴を把握する。その情報に、形態的、生態的特性値等を加えた系群判断の基準となるデータベース...
北海道周辺に分布するニシンの遺伝情報を利用した集団構造解析技術開発 Ⅰ
摘要 北海道周辺に分布するニシンの系群について、産卵期に産卵場で採集された産卵親魚のmtDNA 分析を行って遺伝的特徴を把握する。その情報に、形態的、生態的特性値等を加えた系群判断の基準となるデータベース...
ニシン系群特性値データベースを用いた本州および韓国東岸ニシンの個体群分析
摘要 韓国国立水産科学院および日本海区水産研究所と道総研が共同して研究を実施し、日本海におけるニシン資源の系群構造について上記課題で作成されたデータベースに基づいて共同研究機関で協議しながら解析する。
ニシン系群特性値データベースを用いた本州および韓国東岸ニシンの個体群分析
摘要 韓国国立水産科学院および日本海区水産研究所と道総研が共同して研究を実施し、日本海におけるニシン資源の系群構造について上記課題で作成されたデータベースに基づいて共同研究機関で協議しながら解析する。
① 農業生物のゲノム解読の推進とゲノムリソースの拡充・高度化
摘要 1.生物研で担当しているコムギ6B染色体を含め、21対の染色体ごとの概要配列解読が終了し、国際コムギゲノム解読コンソーシアム(IWGSC)として26年9月にScience誌に発表した。この概要配列情報は、マーカ...
摘要 1. 日本で育成された多収の飼料イネ品種のゲノム構造を識別するSNPセット(1,152 SNPs)を作成してゲノム構造を調査した結果、同品種群は温帯日本型、インド型、中間型に分類された。中間型品種群における温...
摘要 1. トマトモザイクウイルス(ToMV)の複製の分子機構解明に向け、ToMV複製タンパク質のヘリカーゼドメイン(ToMV-Hel)と宿主の複製阻害因子Tm-1との複合体の結晶構造解析と各種変異体の動力学計算解析を行った...
摘要 1. ツマグロヨコバイの共生リケッチアはヨコバイの細胞の細胞質だけでなく細胞核内、さらには成熟した精子の核内にも存在していた。共生リケッチア感染ヨコバイと非感染ヨコバイの交配実験の結果、感染雌か...
ニシン系群特性値データベースを用いた本州および韓国東岸ニシンの個体群分析
摘要 韓国国立水産科学院および日本海区水産研究所と道総研が共同して研究を実施し、日本海におけるニシン資源の系群構造について上記課題で作成されたデータベースに基づいて共同研究機関で協議しながら解析する。
北海道周辺に分布するニシンの遺伝情報を利用した集団構造解析技術開発 Ⅰ
摘要 北海道周辺に分布するニシンの系群について、産卵期に産卵場で採集された産卵親魚のmtDNA 分析を行って遺伝的特徴を把握する。その情報に、形態的、生態的特性値等を加えた系群判断の基準となるデータベース...
ニシン系群特性値データベースを用いた本州および韓国東岸ニシンの個体群分析
摘要 韓国国立水産科学院および日本海区水産研究所と道総研が共同して研究を実施し、日本海におけるニシン資源の系群構造について上記課題で作成されたデータベースに基づいて共同研究機関で協議しながら解析する。
北海道周辺に分布するニシンの遺伝情報を利用した集団構造解析技術開発
摘要 北海道周辺に分布するニシンの系群について、産卵期に産卵場で採集された産卵親魚のmtDNA 分析を行って遺伝的特徴を把握する。その情報に、形態的、生態的特性値等を加えた系群判断の基準となるデータベース...
北海道周辺に分布するニシンの遺伝情報を利用した集団構造解析技術開発
摘要 北海道周辺に分布するニシンの系群について、産卵期に産卵場で採集された産卵親魚のmtDNA 分析を行って遺伝的特徴を把握する。その情報に、形態的、生態的特性値等を加えた系群判断の基準となるデータベース...
北海道周辺に分布するニシンの遺伝情報を利用した集団構造解析技術開発 Ⅰ
摘要 北海道周辺に分布するニシンの系群について、産卵期に産卵場で採集された産卵親魚のmtDNA 分析を行って遺伝的特徴を把握する。その情報に、形態的、生態的特性値等を加えた系群判断の基準となるデータベース...
スギの連鎖不平衡データを用いたジェノミックセレクション解析法のモデルの作成
摘要 ① 枝変わり大果変異セイヨウナシの大果形質の原因が、細胞層の一部が4倍体となっている倍数性周縁キメラであることを特定した。 ② オーム解析により果実成長や品質決定に関わる重要な遺伝子、タンパク質...
スギ精英樹の形質データの再測定及び次世代検定林データの収集とりまとめ
摘要 ① 枝変わり大果変異セイヨウナシの大果形質の原因が、細胞層の一部が4倍体となっている倍数性周縁キメラであることを特定した。 ② オーム解析により果実成長や品質決定に関わる重要な遺伝子、タンパク質...
摘要 ① 枝変わり大果変異セイヨウナシの大果形質の原因が、細胞層の一部が4倍体となっている倍数性周縁キメラであることを特定した。 ② オーム解析により果実成長や品質決定に関わる重要な遺伝子、タンパク質...
RNA-Seq法による品種間トランスクリプトーム比較解析手法の開発
摘要 リファレンス3品種(日本晴、コシヒカリ、カサラス)と地域品種7種(コシヒカリSBL1、ほしのゆめ、ひとめぼれ、てんこもり、てんたかく、ヒノヒカリ、元気つくし)のNGSゲノム解読( 平均 x40のreadsで)を...
摘要 RAP-DB上のアノテーションを改訂や大規模RNA解読のデータの追加を行った。また、大規模な自然変異アリルの表示、比較が可能なプログラムのプロトタイプを作成し、検証した。
摘要 データベースの年間の利用は訪問件数で約85万件。ポータルサイトAgrIDの公開を行った。JSTのバイオサイエンスデータベースセンターと連携し、データベースのアーカイブ化、4省庁横断検索システムを構築。