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PLUGマーカーは類似性の高いコムギ同祖遺伝子の染色体位置を効率的に決められる

要約 イネ遺伝子とコムギEST配列より作られるPLUG（PCR-based Landmark Unique Gene）マーカーは、コムギのA、B、Dゲノム由来の３つの同祖遺伝子からのイントロン領域を含む断片を特異的に増幅し、さらにイントロ...

果樹のゲノム情報解析支援システム

要約 　果樹の発現遺伝子やゲノム配列の情報、DNAマーカーや多型情報などをデータベース化して相互に関連づけることが可能なシステムである。公開されている注釈情報を利用した遺伝子の機能推定や品種判別などに...

ナシ黒星病等の病害防除支援情報システム「梨病害防除ナビゲーション」

要約 「梨病害防除ナビゲーション」はMicrosoft Excel 2003 上で稼働し、ナシ黒星病菌胞子飛散状況、黒星病感染危険度、散布農薬の残効期間等の情報をチャート化して示す。チャートで黒星病の発生生態等の理解、...

福井県産農林水産物の栄養成分のデータベースシステム

要約 本データベースは、「五訂日本食品標準成分表」に掲載されていない福井県特産農林水産物の栄養成分を明らかにしたもので、福井県独自の調理・加工方法ごとに、その調理例と併せてインターネットのホームペー...

小麦品質関連遺伝子型を判別するDNAマーカー

要約

DNAマーカーによって、小麦の硬軟質性に関与するピュロインドリン変異の主要な遺伝子型（Pina-D1b、Pinb-D1b）の判別、製パン性や生地物性に関与するグルテニンサブユニットGlu-B1i、Glu-D1d、Glu-B3gの...

集落営農合意形成のための「集落営農組織化効果試算シート」

要約 「集落営農組織化効果試算シート」は、水稲・小麦・大豆の経営規模別農業技術体系データを利用し、集落の農家毎の「現状」の土地利用状況と、農地や作業を営農組織や担い手農業者に集積するなどの「改革案」...

ブタ完全長cDNA配列10,147個の解読とそのデータベースの構築

要約 ブタの15種類の組織・細胞に由来する完全長cDNAライブラリーを用いて、約16万個のクローンからESTを取得した。さらに代表的なクローンを抽出し、5,600個以上の遺伝子に相当する10,147個の完全長cDNA配列の決...

BAC末端塩基配列を利用したカイコSNP連鎖地図構築

要約 カイコBACクローン約8万の両末端塩基配列解析した。その情報を元にカイコ品種p50TとC108T間で検出した一塩基多型（SNP）を利用し、BACをマーカーとした高密度のSNP連鎖地図を構築した。 キーワード カイコ、...

牛肉のプロテオーム解析データベース

要約 牛肉のプロテオーム解析データベースを構築し、インターネットで公開した。ウシ胸最長筋の全筋蛋白質を２次元電気泳動した泳動図上より、各スポットの蛋白質情報をみることができる。 キーワード プロテオー...

チンゲンサイ、キャベツ根内から初めて見出された窒素固定細菌

要約 チンゲンサイ及びキャベツの根内から見出された５菌株に窒素固定能が認められた。16S rRNA遺伝子の部分塩基配列（500 bp）の相同性よりこれらの菌株の一部は、Bacillus属、Pseudomonas 属、Rhodopseudomonas...

カンキツの22K オリゴDNAマイクロアレイの開発

要約 　果樹研究所で行った発現遺伝子の解析情報、および、公開情報をもとに設計した 21,495個のカンキツ由来の独立遺伝子を搭載するオリゴDNAマイクロアレイである。搭載されている約60%の遺伝子について遺伝子...

DNAマーカーによる果樹・果実の品種判別

要約 　果樹・果実や加工品のDNA鑑定、親子鑑定、DNAマーカーデータベースや品種判別を支援するプログラムの利用により、主要果樹の品種が判別できる。 キーワード DNA鑑定、品種判別、果実、加工品 背景・ねらい...

公開データベース配列情報を利用したトマトSSRマーカーの開発

要約 　栽培トマトのゲノムおよびcDNA配列情報に基づいて開発した400以上のSSR（単純反復配列）マーカーは、トマト品種・系統間で平均約30%の多型頻度を示し、SSRの繰り返し単位の反復数に応じて多型検出頻度が高...

イネウンカ類長距離移動の多段経路を推定する方法

要約 　日本でのウンカトラップ誘殺データ数を用いて後退軌道解析を行い、、飛来源を推定する。その地点のにおけるの日最高・最低気温有効積算温度を用いて１，２1，2世代前の飛来日を推定する。その飛来日から後...

画像解析を用いた牛枝肉品質の高精度計測システム

要約 枝肉横断面撮影装置と画像解析ソフトウエアからなる牛枝肉品質の高精度計測システムを開発し､その肉質情報をフィードバックする体制を構築した。これにより客観的で精細な肉質情報を得ることができ､生産現場...

SSRマーカーによるトウモロコシ自殖系統の遺伝子型のプロファイリング

要約

SSRマーカーにより推定したトウモロコシ自殖系統間の近縁度に基づくトウモロコシ自殖系統の遺伝子型のプロファイリングにより、自殖系統間の近縁関係を把握できる。プロファイリングの情報は、自殖系統...

近縁係数による糖量に優れたテンサイ組合せ選抜法

要約

テンサイ育成系統間の交配データベースに基づくプログラムにより、育成系統間の近縁係数を容易に算出できる。算出した近縁係数は、一代雑種の根重および糖量と高い相関を示すことから、糖量に優れるテン...

264種類のSSRマーカーについてサクラ属標準地図上での座乗領域を同定

要約 　アーモンド「テキサス」とモモ「アーリーゴールド」のF2集団6個体を用いて、合計264種類のSSRマーカーが、サクラ属標準地図上の67領域に位置付けられる。本標準地図上にマッピング済みの185種類のSSRマー...

営農計画のための農業技術体系データベースシステム

要約 　農業技術体系データベースは、農業生産に関わる投入・産出量を農作業スケジュールと関連づけて体系的に蓄積・共有することができる。データベース構築から営農計画作成までを統合化・システム化することで...

シクラメンの脂肪酸不飽和化酵素遺伝子の単離とノックダウンベクターの構築

要約 シクラメンの脂肪酸不飽和化酵素遺伝子（CpFAD:Cyclamen persicum Fatty Acid Desaturase gene）をTAIL-PCR法により単離して塩基配列を明らかにした。CpFADは、全長3,939塩基であり、8カ所のエクソンと7カ所...