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ニホンナシの交雑育種における重要形質に関連したDNAマーカー情報の整理

要約 主要なニホンナシ59品種・系統におけるニホンナシの重要な育種形質(黒星病抵抗性、自家和合性、早生性、果皮色、黒斑病抵抗性)の遺伝子型および表現型情報を利用することで、ニホンナシ品種育成を加速化する...

トマト品種系統間でも多型検出が容易なゲノムワイドSSRマーカー

要約 トマトゲノム配列を元に開発した2,510個のSSR(単純反復配列)マーカーは、多型頻度やアリル出現数に優れることから、品種系統間交雑の後代集団における遺伝・量的形質遺伝子座(QTL)解析のための連鎖地図や、...

キク栽培品種を利用した網羅的EST解析

要約 キク栽培品種「セイマリン」由来の発現遺伝子配列断片(expressed sequence tag、EST)情報の網羅的解析により構成された213,204個の相同連結配列(コンティグ)情報をキクのゲノム育種研究のための基盤情報とし...

ネギの抽だい期を支配するQTL

要約 ネギの抽だい期に関与する主要な量的形質遺伝子座(QTL)は、連鎖群Chr. 1aおよびChr. 2a上に存在する。ネギ品種「TA-4」の抽だいを遅らせる主要なQTL...

キヌアの標準自殖系統とゲノム配列

要約 分子レベルでの解析に適した遺伝的に均質なキヌアの標準自殖系統を開発し、キヌアのゲノム（生物の設計図）配列を世界に先駆けて解読した。これらの...

ネギの発現遺伝子配列を活用したDNAマーカー

要約 次世代型DNAシーケンサーを用いて取得したネギの5.5万の独立遺伝子配列には、2,000以上のSSRが含まれるとともに、系統間の配列比較からDNA多型を検出することにより効率的にDNAマーカーを作成できる。 キー...

ナス半枯病抵抗性遺伝子座の同定と育種選抜マーカーの開発

要約 ナス系統LS1934が有する半枯病抵抗性は第2染色体末端の遺伝子座FM1によって支配されている。同遺伝子座は2つのSSRマーカーによって選抜可能である。 キーワード ナス、半枯病抵抗性、土壌伝染性病害、育種選...

ダイズペクチンメチルエステラーゼは蒸煮大豆の硬さに関与する

要約 ペクチンメチルエステラーゼのホモログであるダイズ遺伝子Glyma03g03360には、少なくとも4つの多型が存在する。このタンパク質が、酵素活性に重要なアミノ酸を含むC末端部位を欠失すると、蒸煮大豆...

トマトの高品質多収育種のためのゲノム情報に基づく高精度形質予測

要約 ゲノム全体に配置したDNAマーカー情報に基づく形質予測モデルおよび交雑後代のゲノム構成コンピューターシミュレーションによって、トマトの果実糖度と果実収量を同時に向上させる育種過程を高精度に予測で...

SNPマーカーを利用したニホンナシ高密度連鎖地図

要約 本連鎖地図は、発現遺伝子情報に由来するSNPマーカーを主として構築された、ニホンナシ「豊水」の高密度連鎖地図である。ニホンナシゲノムの大部分をカバーしていると考えられ、リンゴやセイヨウナシ標準連...

蒸煮大豆の硬さに関与するQTLの同定とDNAマーカーの開発

要約 蒸煮大豆の硬さに関与する効果が大きいQTLは第3染色体上に座乗する。QTL領域に開発した2つのDNAマーカーは蒸煮大豆の硬さの判別に有用である。 キーワード ダイズ、QTL、DNA マーカー、加工適性、蒸煮硬度 ...

サツマイモ二倍体近縁野生種Ipomoea trifidaのゲノム配列情報

要約 サツマイモ近縁野生種Ipomoea trifidaの固定系統Mx23Hmのゲノム解読で得られた512.9メガ塩基対のDNA配列中には、62,403箇所の遺伝子領域が存在する。ゲノム配列情報および遺伝子情報はデータベース...

LAMP法によるニホンナシ自家和合性個体の選抜

要約 開発したLAMPプライマーセットによって、簡便、迅速かつ高額機器を必要とせずにニホンナシS ハプロタイプが判定できることから、S₄^smハプロタイプを有する自...

ピーマンのSSR(単純反復配列)マーカーと高密度連鎖地図

要約 新たに開発したゲノムおよびcDNA配列由来のSSRマーカーを用いて作成したピーマンの高密度連鎖地図は、12連鎖群に収束し、種間交雑F2集団より作成された既知の基本連鎖地図およびトマトゲノム配列と対応付け...

長い塩基反復単位を持ち誤判定の少ないニホンナシの新規SSRマーカー

要約 ニホンナシ「豊水」の次世代シーケンス解析から開発した4, 5, 10-14塩基反復単位を持つ合計120種類のSSRマーカーは、ナシの連鎖地図上に位置づけられる高精度DNAマーカーである。 キーワード ニホンナシ、SS...

ニホングリ易渋皮剥皮性を判別するDNAマーカー

要約 開発した6種類のマーカーはニホングリの易渋皮剥皮性と強く連鎖する。これらのマーカーを用いた遺伝子型解析の結果、易渋皮剥皮性は在来品種の「乙宗」に由来する。マーカーおよび遺伝子型情報を利用して、...

スギ雄性不稔遺伝子に連鎖するDNAマーカーの開発 －DNAによる無花粉スギ識別の道が拓ける－

要約 スギ高密度連鎖地図を構築し、雄性不稔遺伝子が第9連鎖群に存在することを明らかにし、無花粉スギ（雄性不稔スギ）の家系内選抜を高い精度で行うことができるDNAマーカーを開発しました。 背景・ねらい スギ...

リンゴ全ゲノムをカバーする台木および野生種の連鎖地図

要約 リンゴ台木「JM7」とリンゴ属野生種のミツバカイドウ「サナシ63」の連鎖地図はほぼ全ゲノムをカバーし、多数のSSRマーカーを含む。このためリンゴ台木重要形質解析の基盤として用いることができる。 キーワ...

レトロトランスポゾン挿入多型に基づくニホンナシの品種特異的DNAマーカー

要約 レトロトランスポゾン配列および隣接するナシのゲノム配列から開発した22種類のレトロトランスポゾン挿入多型マーカーのうち、3種類を利用して「豊水」を他の品種から識別することができ、ニホンナシ品種特...

遺伝子機能の解明やDNAマーカー開発に有効なカンキツのゲノム情報

要約 カンキツの発現遺伝子情報のうち67.6～81.9%の機能が推定され、86.1%がゲノム配列と対応づけられる。SSR候補はESTでは144,000件、ゲノム配列では382,000件見いだされる。17品種間のSNPの頻度から、品種間の...